PRJNA1484006:治疗敏感与治疗耐药乳腺癌细胞系样本的RNA-seq图谱

该数据集为NCBI BioProject(ID 1484006)收录的RNA-seq图谱数据,针对治疗敏感与治疗耐药的乳腺癌细胞系样本进行转录组或基因表达分析

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1484006: RNA-seq profiling of treatment-sensitive and treatment-resistant breast cancer cell-line samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1484006:治疗敏感与治疗耐药乳腺癌细胞系样本的RNA-seq图谱

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-seq 图谱数据,项目编号为 1484006,英文名称为“RNA-seq profiling of treatment-sensitive and treatment-resistant breast cancer cell-line samples”。从名称可以看出,该数据集围绕乳腺癌细胞系样本展开,重点比较治疗敏感与治疗耐药两类样本的转录组或基因表达特征。数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其核心数据类型是 RNA 测序所产生的基因表达信息。该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 BioProject 体系下的一个项目记录,用户可通过该记录获取与项目相关的多种数据类型链接。整体而言,该数据集面向乳腺癌治疗敏感性差异的转录组研究,适合用于探索治疗敏感与耐药细胞系之间基因表达层面的差异。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 1484006。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议所汇集的生物学数据集合,通常来自单一机构或联合体。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集聚焦于乳腺癌细胞系,围绕治疗敏感与治疗耐药两类样本开展 RNA-seq 图谱分析,属于肿瘤 / 乳腺癌研究范畴,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。源站标题显示为“RNA-seq profiling of treatment-sensitive and treat... (ID 1484006) - BioProject - NCBI”,表明该记录是 NCBI BioProject 数据库中的一个项目条目。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 RNA-seq 图谱数据,针对治疗敏感与治疗耐药的乳腺癌细胞系样本进行转录组或基因表达分析。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明数据主要反映基因表达层面的信息。数据集英文名称明确提到“treatment-sensitive and treatment-resistant breast cancer cell-line samples”,即治疗敏感与治疗耐药的乳腺癌细胞系样本。关于样本数量、测序平台、读长、表达矩阵、差异基因列表等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 体系,项目编号为 1484006。BioProject 记录本身是围绕单一研究计划或倡议所汇集的生物学数据集合,来源于单一机构或联合体,并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、细胞系具体名称、培养条件、处理方案、测序机构等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌治疗敏感性差异相关的转录组研究场景。由于数据涉及治疗敏感与治疗耐药的乳腺癌细胞系样本,并属于“Transcriptome or Gene expression”主题,可用于探索两类样本在基因表达层面的差异。其 BioProject 属性也使其适合作为项目级入口,用于查找与该研究计划相关的多种数据类型。关于具体的分析场景、疾病亚型、药物类型或临床转化用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问,项目编号为 1484006,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 记录提供统一入口,用户可借此查找与该项目相关的多种数据类型链接。关于数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或代码等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的项目记录,其描述说明 BioProject 是围绕单一研究计划或倡议所汇集的生物学数据集合,来源于单一机构或联合体,并提供统一入口以链接多种数据类型。关于数据质量指标、测序深度、重复数、批次效应、数据完整性或使用限制等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 1484006,属于 NCBI BioProject 记录。关于引用格式、许可协议、使用条款或数据共享政策等具体信息,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1484006

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对人类乳腺癌细胞系样本进行了批量RNA测序,以比较治疗敏感与治疗耐药条件下的转录组谱。总体设计:分析了六个细胞系RNA-seq文库,包括三个治疗敏感生物学重复和三个治疗耐药生物学重复。基因表达值以处理后的FPKM矩阵形式提供。

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