PRJNA1483379:THP-1中POLR3G和POLR3GL敲除及HEK293T中POLR3G敲低的小RNA测序
该数据可用于研究POLR3G与POLR3GL在转录组或基因表达调控中的作用,以及小RNA层面的变化,适合开展基因功能与表达调控相关的分析(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
PRJNA1483379:THP-1中POLR3G和POLR3GL敲除及HEK293T中POLR3G敲低的小RNA测序
PRJNA1483379 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的小 RNA 测序项目,英文全称为“small RNA seq: POLR3G and POLR3GL knockout in THP-1 and POLR3G knockdown in HEK293T”。从名称可以看出,该项目围绕 POLR3G 与 POLR3GL 两个基因,在 THP-1 与 HEK293T 两种细胞背景下开展了敲除或敲低处理,并在此基础上进行小 RNA 测序。该数据集在本站被归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,提示其数据内容与转录组或基因表达调控相关。整体而言,该数据集可用于研究 POLR3G 与 POLR3GL 在转录组或基因表达调控中的作用,以及小 RNA 层面的变化,适合开展基因功能与表达调控相关的分析。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,源站标题为“small RNA seq: POLR3G and POLR3GL knockout in THP-... (ID 1483379) - BioProject - NCBI”。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议而汇集的一组生物学数据,通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该项目聚焦于 POLR3G 与 POLR3GL 两个基因,在 THP-1 细胞中开展敲除实验,在 HEK293T 细胞中开展 POLR3G 敲低实验,并采用小 RNA 测序手段获取数据。本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类,主题标签为转录组或基因表达。
【数据内容】
该数据集的核心内容为小 RNA 测序数据,涉及 POLR3G 与 POLR3GL 在 THP-1 细胞中的敲除,以及 POLR3G 在 HEK293T 细胞中的敲低。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明数据与转录组或基因表达相关。关于具体的样本数量、测序深度、读长、数据量、文件格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 NCBI BioProject 数据库,项目编号为 PRJNA1483379。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划或倡议、来自单一机构或联合体的生物学数据集合,并为用户提供查找该项目多种数据类型的统一入口。关于具体的实验操作流程、细胞培养条件、测序平台、建库方法、采集时间与地点等信息,源站未提供。
【适用场景】
根据侧写线索,该数据可用于研究 POLR3G 与 POLR3GL 在转录组或基因表达调控中的作用,以及小 RNA 层面的变化,适合开展基因功能与表达调控相关的分析。结合本站分类“肿瘤 / 乳腺癌”,该数据集可能适用于与肿瘤或乳腺癌相关的基因功能研究场景。关于更具体的适用分析类型或疾病模型,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。通常可通过 NCBI BioProject 记录入口查找该项目关联的多种数据类型,但针对本数据集的具体下载方式、分析流程或操作步骤,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、覆盖度、重复数、批次效应或其它技术限制的说明。由于缺乏样本数量、测序深度、数据量等具体指标,无法对数据质量做出进一步判断。相关限制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1483379
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
RNA聚合酶III(Pol III)合成对翻译、RNA加工和转录调控至关重要的非编码RNA。其活性与细胞生长和营养可用性相一致,其失调与乳腺癌和脑白质营养不良等疾病有关。在此,我们探究了THP-1中POLR3G和POLR3GL敲除以及HEK293T中POLR3G敲低对小RNA表达的影响。总体设计:在THP-1中敲除POLR3G和POLR3GL,并在HEK293T中通过使用200nM靶向POLR3G的ASO处理细胞48小时来敲低POLR3G。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




