MDA-MB-231与MDA-MB-453细胞abemaciclib和/或fulvestrant处理的RNA-seq分析
数据主题属于转录组或基因表达，可用于研究上述药物单独或联合作用下乳腺癌细胞的基因表达变化，帮助探索药物响应机制与潜在联合用药策略（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
MDA-MB-231与MDA-MB-453细胞abemaciclib和/或fulvestrant处理的RNA-seq分析
该数据集为 NCBI BioProject 收录的转录组学项目，英文名称为“PRJNA1482501: RNA-seq analysis of MDA-MB-231 and MDA-MB-453 cells treated with abemaciclib and/or fulvestrant”，源站标题为“RNA-seq analysis of MDA-MB-231 and MDA-MB-453 cell... (ID 1482501) - BioProject - NCBI”。项目围绕两种乳腺癌细胞系 MDA-MB-231 与 MDA-MB-453，在 abemaciclib 和 fulvestrant 单独或联合处理条件下开展 RNA-seq 分析，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。本站将其归类为肿瘤 / 乳腺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集可用于观察上述药物干预后乳腺癌细胞基因表达层面的变化，为理解药物响应机制及潜在联合用药策略提供转录组数据基础。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议而汇集生物数据的集合，通常由单一机构或联合体发起，其记录为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本项目聚焦乳腺癌细胞系，选择 MDA-MB-231 和 MDA-MB-453 两种细胞，并设置 abemaciclib 与 fulvestrant 单独或联合处理的实验条件，通过 RNA-seq 分析转录组或基因表达情况。本站分类将其归入肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。关于该研究的具体发起机构、研究背景的详细描述，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 RNA-seq 分析，研究对象是 MDA-MB-231 和 MDA-MB-453 细胞，处理条件包括 abemaciclib 和/或 fulvestrant。数据主题属于转录组或基因表达，因而其内容应涉及在上述药物单独或联合作用下，乳腺癌细胞中基因表达变化的相关数据。源站描述仅说明 BioProject 作为数据集合的通用性质，未进一步列出该项目的样本数量、测序平台、数据量、文件格式或具体分析结果。除主题标签“Transcriptome or Gene expression”外，源站未提供更细的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示其属于 BioProject，编号为 1482501。项目英文名称表明其采集对象为经 abemaciclib 和/或 fulvestrant 处理的 MDA-MB-231 与 MDA-MB-453 细胞，并开展 RNA-seq 分析。关于样本采集的具体时间、地点、操作流程、伦理审批信息以及测序实验的详细方案，源站未提供。
【适用场景】
依据其主题标签与研究对象，该数据集可用于研究上述药物单独或联合作用下乳腺癌细胞的基因表达变化，帮助探索药物响应机制与潜在联合用药策略。由于涉及两种乳腺癌细胞系，也可用于比较不同细胞背景下的转录组响应差异。本站分类为肿瘤 / 乳腺癌，因此适用于乳腺癌相关的基础研究或转化研究场景。关于该数据集是否适用于临床决策、药物靶点验证或生物标志物筛选等具体用途，源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式提供，用户可通过 NCBI 的 BioProject 入口查找与该项目相关的多种数据类型。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供单一入口，以便找到该项目生成的不同类型数据。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开数据库记录。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，研究对象为两种乳腺癌细胞系及两种药物的单独或联合处理。关于数据质量评估指标、测序深度、重复次数、批次效应、数据完整性或潜在偏差等信息，源站未提供。此外，该数据集基于细胞系实验，其结论向临床或体内情境的外推程度，源站未提供说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“RNA-seq analysis of MDA-MB-231 and MDA-MB-453 cell... (ID 1482501) - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1482501
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
视网膜母细胞瘤蛋白（Rb）是一种肿瘤抑制因子，以抑制E2F转录因子并阻止细胞周期进展而著称。在激素受体阳性（HR+）乳腺癌中，CDK4/6抑制剂通过阻止Rb磷酸化来激活Rb，构成当前内分泌治疗方案的关键组成部分。药理学激活的Rb如何重塑染色质并在细胞周期阻滞之外影响转录，仍知之甚少。在此，我们展示CDK4/6抑制诱导低磷酸化Rb重新分布至启动子和增强子。虽然Rb如预期般结合细胞周期基因启动子以抑制转录，但在其他位点，它通过整合入富含雌激素受体（ER）的转录枢纽，意外地促进雌激素响应基因的表达。CDK4/6抑制以Rb依赖的方式增强乳腺癌细胞、患者来源异种移植瘤以及临床HR+乳腺癌样本中的ER靶基因表达。这种重编程部分由KDM5A介导，其与Rb的相互作用有助于这些位点的基因调控。关键的是，这一Rb驱动的ER转录程序的组成部分具有促增殖作用。
在内分泌敏感性肿瘤中，这可以通过抗雌激素治疗被中和，从而解释了治疗协同作用。在内分泌耐药的情况下，如ESR1突变型乳腺癌，该程序持续存在，限制了治疗效果。这些发现重新定义了Rb，将其视为一种双功能转录调节因子，它在执行细胞周期阻滞的同时，也能激活抵消其抑癌功能的程序。总体设计：对ER阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231和MDA-MB-453细胞进行3’RNA-seq分析，这些细胞分别用DMSO对照、500 nM abemaciclib、5 nM fulvestrant或abemaciclib与fulvestrant联合处理5天。每组三个生物学重复。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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