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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1478591：三阴性乳腺癌中Leptin受体与Hippo/YAP轴互作 [RNA-Seq Allo-aca]

该数据集为 NCBI BioProject 收录的编号 1478591 项目，英文名称为 PRJNA1478591: The Reciprocal activation between Leptin Receptor and Hippo/YAP axis in Triple Negative Breast Cancer Development [RNA-Seq Allo-aca]。其研究主题聚焦于三阴性乳腺癌发生过程中 Leptin 受体与 Hippo/YAP 轴之间的相互激活关系，所采用的技术路线为 RNA-Seq Allo-aca，归属于转录组或基因表达这一主题范畴。从分类角度看，该数据集被归入肿瘤 / 乳腺癌方向，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据的集合性记录，通常围绕某一项单一研究计划组织，可来自单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。该数据集即属于此类项目记录，围绕特定乳腺癌研究计划汇集相应的基因表达数据资源。

【数据集背景】

该数据集对应的研究计划关注三阴性乳腺癌的发生机制，核心科学问题在于 Leptin 受体与 Hippo/YAP 轴之间的相互激活关系。三阴性乳腺癌是乳腺癌的一种亚型，其发生发展涉及复杂的分子调控网络。Leptin 受体与 Hippo/YAP 轴均为与细胞增殖、分化及肿瘤进展相关的信号通路组成部分，二者之间的相互激活可能在该疾病进程中发挥重要作用。该 BioProject 记录即围绕这一研究主题建立，用于汇集由该研究计划产生的生物学数据。源站描述指出，BioProject 记录来自单一组织或联合体，围绕单一研究计划组织，并为用户提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一位置。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目名称中标注了 RNA-Seq Allo-aca，说明该研究采用了 RNA-Seq 相关方法，并涉及 Allo-aca 这一具体实验条件或处理方式。数据内容围绕三阴性乳腺癌中 Leptin 受体与 Hippo/YAP 轴相互激活这一主题展开，属于基因表达层面的数据集合。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、基因数量、差异表达结果等更具体的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条项目记录，项目 ID 为 1478591。BioProject 作为生物数据的集合，其记录可来自单一组织或联合体，围绕单一研究计划组织，并提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。该数据集即通过这一机制进行收录与展示。关于具体样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验操作流程等细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与项目名称，该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕三阴性乳腺癌发生机制、Leptin 受体信号通路以及 Hippo/YAP 轴相互激活关系的研究。研究人员可将其用于基因表达层面的分析、通路激活关系的探索，或作为相关乳腺癌分子机制研究的参考数据资源。此外，由于该记录属于 BioProject 体系，也可用于查找与该研究计划相关的其他数据类型链接。关于更具体的适用分析类型或应用方向，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库进行访问，项目 ID 为 1478591，英文名称为 PRJNA1478591。用户可借助 BioProject 记录所提供的统一入口，查找该项目所生成的多种数据类型及其相关链接。关于数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于项目层面的记录，其描述指出 BioProject 提供用户查找项目相关多种数据类型链接的统一位置。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、样本量大小等具体质量信息，源站未提供。此外，该记录本身为项目登记信息，可能不包含完整的原始数据或分析结果，用户需通过其提供的链接进一步获取相关数据。关于该数据集的具体限制条件，源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及数据共享政策等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 数据库的相关规定以及该项目记录所链接的原始数据来源的引用要求。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335457

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1478591

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）是最具侵袭性的乳腺癌亚型，有效治疗靶点有限。在TNBC中常观察到Hippo/YAP轴的过度激活，但针对Hippo通路的有效治疗性抑制剂在临床上仍不可用。近期研究提示肥胖与乳腺癌风险增加之间可能存在关联，而乳腺脂肪细胞在TNBC发展中发挥重要作用，但其具体机制仍不清楚。在我们的研究中，我们确定瘦素信号是Hippo/YAP激活和TNBC进展的重要介质。来自脂肪细胞的旁分泌瘦素激活瘦素受体（LEPR），随后通过LEPR/JAK2/SRC轴诱导YAP Tyr357磷酸化和YAP核转位。此外，YAP还可结合LEPR启动子并增强其转录，从而在TNBC进展中形成正反馈环路。

脂肪细胞分泌的旁分泌瘦素可在TNBC发生和进展中激活瘦素信号与Hippo通路之间的正反馈，而通过抑制LEPR对该环路进行药物靶向可显著抑制TNBC的癌变和进展。总之，我们的数据揭示了瘦素系统与Hippo/YAP轴相互作用在脂肪细胞诱导的乳腺癌发生中的新机制，并提出了靶向膜受体LEPR治疗TNBC的有前景的策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别