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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1477815：慢性IL-1暴露减弱BCa细胞系IL-1反应并改变基因表达调控同时维持治疗敏感性

该数据集为 NCBI BioProject 收录的转录组或基因表达研究项目（ID 1477815），英文名称为“Chronic IL-1 exposure attenuates IL-1 response and alters gene expression regulation while maintaining therapeutic sensitivity in BCa cell lines”。其研究方向属于肿瘤 / 乳腺癌领域，核心关注点是慢性 IL-1 暴露对乳腺癌（BCa）细胞系的影响。根据源站描述，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，来源于单一机构或联盟，并为用户提供统一入口，以链接该项目所产生的多种数据类型。该项目以转录组或基因表达为主题标签，提示其数据主要围绕基因表达层面的变化展开。整体来看，该数据集可用于了解慢性 IL-1 暴露条件下 BCa 细胞系在 IL-1 反应、基因表达调控以及治疗敏感性维持方面的研究背景与数据组织方式。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1477815，源站标题为“Chronic IL-1 exposure attenuates IL-1 response and... (ID 1477815) - BioProject - NCBI”。从标题和主题标签可知，该项目围绕慢性 IL-1 暴露对 BCa 细胞系的影响展开。研究关注的核心现象包括：慢性 IL-1 暴露后，细胞对 IL-1 的反应减弱；基因表达调控发生改变；与此同时，细胞仍维持治疗敏感性。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容与转录组或基因表达相关。BioProject 作为生物数据集合的记录形式，通常用于整合一个研究计划下产生的多种数据类型，并提供统一的访问入口。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目英文名称进一步说明，研究涉及慢性 IL-1 暴露后 BCa 细胞系的 IL-1 反应变化、基因表达调控改变以及治疗敏感性的维持。关于具体的样本数量、测序平台、数据文件类型、表达矩阵或差异基因列表等详细信息，源站未提供。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，因此其数据内容在领域上可归入乳腺癌相关研究。BioProject 记录本身提供的是项目层面的链接入口，用于关联该项目产生的多种数据类型，但具体数据组成需以源站实际记录为准。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库。项目编号为 1477815，英文名称为“PRJNA1477815: Chronic IL-1 exposure attenuates IL-1 response and alters gene expression regulation while maintaining therapeutic sensitivity in BCa cell lines”。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，来源于单一机构或联盟，并提供用户查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。关于样本采集的具体方法、细胞系来源、处理条件、实验设计细节、测序或检测平台等信息，源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集的主题标签和项目名称，其适用场景可包括：转录组或基因表达相关研究；慢性 IL-1 暴露对 BCa 细胞系影响的机制探索；IL-1 反应减弱与基因表达调控改变的分析；以及治疗敏感性维持相关研究的背景参考。该数据集属于肿瘤 / 乳腺癌方向，可用于乳腺癌细胞系在炎症因子慢性暴露条件下的表达调控研究。关于具体的分析流程、统计方法或临床应用场景，源站未提供。

【使用方法】

该数据集来自 NCBI BioProject，用户可通过源站记录查找该项目所链接的多种数据类型。BioProject 记录提供统一入口，便于用户定位与该项目相关的数据资源。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、参数设置或复现步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 记录，源站描述说明其用于汇集与单一研究计划相关的生物数据，并提供链接入口。关于数据质量评估指标、样本量、重复数、测序深度、覆盖度、批次效应、验证实验或局限性说明，源站未提供。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，项目名称涉及慢性 IL-1 暴露对 BCa 细胞系的影响，但具体结论的适用范围和限制条件需依据源站记录进一步确认。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1477815，英文名称为“PRJNA1477815: Chronic IL-1 exposure attenuates IL-1 response and alters gene expression regulation while maintaining therapeutic sensitivity in BCa cell lines”。关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335261

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1477815

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性炎症是乳腺癌肿瘤微环境的一个标志性特征，也已知与疾病进展和治疗反应相关。白细胞介素-1（IL-1）信号传导在乳腺癌生物学中已被广泛研究；然而，持续性IL-1暴露对激素受体阳性乳腺癌细胞的长期效应仍知之甚少。在本研究中，我们探讨了慢性IL-1暴露如何影响ERα+/PR+乳腺癌模型MCF7和T47D中的炎症反应、激素依赖性和治疗敏感性。慢性IL-1暴露减弱了对后续急性IL-1处理的反应，但长期暴露的细胞仍对血清剥夺敏感，保留了对雌激素或孕激素受体信号传导的依赖性，并对内分泌治疗和化疗有强烈反应。基础基因表达和组蛋白修饰的广泛变化表明，慢性IL-1暴露改变了转录重编程和染色质重塑。总之，这些发现表明，慢性IL-1信号传导驱动激素受体阳性MCF7和T47D乳腺癌细胞中的选择性炎症反应。

这项工作凸显了激素受体靶向策略在慢性炎症肿瘤中持续具有治疗意义，并有助于理解持续性炎症应激如何塑造肿瘤行为以及被预测可促进肿瘤进展的基因调控。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别