PRJNA1476323：雌激素受体阳性乳腺癌中NF1缺失诱导破骨细胞形成与免疫抑制促进骨转移
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1476323），主题为雌激素受体阳性乳腺癌中 NF1 缺失诱导破骨细胞形成与免疫抑制进而促进骨转移
基本信息
资源简介
PRJNA1476323：雌激素受体阳性乳腺癌中NF1缺失诱导破骨细胞形成与免疫抑制促进骨转移
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1476323，英文标题为“NF1 loss in estrogen receptor-positive breast cancer induces osteoclast formation and immunosuppression to promote bone metastasis”。从标题可以看出，其研究主题聚焦于雌激素受体阳性乳腺癌中 NF1 缺失所引发的生物学效应，具体涉及诱导破骨细胞形成、免疫抑制以及促进骨转移等过程。该数据集在分类上归属于肿瘤／乳腺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。数据来源于 NCBI BioProject，用户可通过该记录集中获取与这一研究计划相关的多种数据类型链接。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1476323。BioProject 是围绕某一项单一研究计划所汇集的生物学数据集合，这些数据通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找由该项目产生的多种数据类型。该项目的标题明确指向雌激素受体阳性乳腺癌中 NF1 缺失与骨转移之间的关系，涉及破骨细胞形成和免疫抑制等机制。本站将其归类为肿瘤／乳腺癌，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明该项目主要产生与转录组或基因表达相关的数据。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目标题所描述的研究涉及 NF1 缺失在雌激素受体阳性乳腺癌中的作用，包括诱导破骨细胞形成、免疫抑制以及促进骨转移。除上述主题信息外，关于具体样本数量、测序平台、数据文件格式、基因表达矩阵或差异表达结果等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1476323。BioProject 作为生物学数据的汇集记录，其数据来自单一研究计划，可能由单一机构或联合体产生。关于具体的样本采集地点、采集时间、实验条件、伦理审批信息以及具体的提交机构名称，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签“Transcriptome or Gene expression”以及项目标题所涉及的研究方向，该数据集可适用于与雌激素受体阳性乳腺癌、NF1 缺失、破骨细胞形成、免疫抑制及骨转移相关的转录组或基因表达分析场景。研究人员可利用该 BioProject 记录查找与之关联的多种数据类型。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1476323）访问该数据集，并利用该记录作为统一入口，查找由该项目产生的多种数据类型链接。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于围绕单一研究计划汇集的生物学数据。关于数据质量评估指标、数据完整性、样本量大小、潜在偏差或使用限制等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议或使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1476323
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
雌激素受体阳性（ER⁺）乳腺癌表现出明显的骨转移倾向；然而，骨定植的分子驱动因素仍未被完全阐明。我们研究了肿瘤抑制因子神经纤维瘤蛋白（NF1），它是RAS和ER信号通路的双重抑制因子，其失活可促进内分泌治疗（ET）耐药，并与较差的无复发生存期相关。在随后发生转移的ER⁺患者中，62%检测到NF1拷贝数缺失，且该缺失与初诊时骨转移可能性增加相关。在小鼠异种移植模型中，原发肿瘤手术切除后，NF1缺失的ER⁺乳腺癌细胞向骨骼部位的播散增强。此外，经髂内注射后，NF1缺失的细胞在骨内产生了显著更大的肿瘤负荷。转录组分析显示，NF1缺失的ER⁺乳腺癌细胞中骨相关基因特征富集，其在共培养系统中更强效地诱导破骨细胞分化和骨丢失。
同时，NF1低表达与原发性乳腺肿瘤和骨转移中T细胞功能状态受抑制相关。与这些临床观察一致，NF1缺失的ER+乳腺癌细胞能更有效地抑制人原代CD8+ T细胞的增殖、干扰素-γ分泌和细胞毒性。总之，这些发现表明，NF1失活是相当一部分ER+乳腺癌发生骨转移的关键驱动因素。NF1缺失通过放大溶骨性“恶性循环”并促进免疫逃逸，重塑微环境以利于肿瘤扩张。这些结果进一步提示，NF1缺失在功能上将治疗耐药与骨骼转移潜能增加联系起来。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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