PRJNA1470620：野生型与Padi4缺陷小鼠肺来源三阴性乳腺癌细胞转录组分析
该数据集为NCBI BioProject（ID 1470620），收录野生型与Padi4缺陷小鼠肺来源三阴性乳腺癌细胞再分离后的转录组表达谱数据，主题标签为Transcriptome or Gene expression，属于肿瘤/乳腺癌分类
基本信息
资源简介
PRJNA1470620：野生型与Padi4缺陷小鼠肺来源三阴性乳腺癌细胞转录组分析
该数据集为 NCBI BioProject 收录的转录组研究项目，编号为 1470620，英文名称为“Transcriptomic profiling of lung-derived triple-negative breast cancer cells re-isolated from wild-type and Padi4-deficient mice”。项目聚焦于肺来源三阴性乳腺癌细胞在野生型小鼠与 Padi4 缺陷小鼠体内再分离后的转录组表达谱，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向。BioProject 作为生物数据集合，通常围绕某一项研究计划，汇集来自单一机构或联合体的多种数据类型，并为用户提供统一入口以查找该项目所产生的各类数据。该数据集即通过这一框架，对外呈现与上述研究相关的转录组数据资源，便于研究者定位和了解该项目的总体内容。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号 1470620。其研究背景涉及三阴性乳腺癌的肺转移相关细胞群体，以及 Padi4 基因缺陷对这类细胞转录组特征的可能影响。项目名称明确指向“肺来源三阴性乳腺癌细胞”在“野生型”与“Padi4 缺陷”小鼠中的再分离与转录组分析。这一设计意味着研究关注的是肿瘤细胞经过体内环境选择后，从肺部重新分离出来的细胞状态，而非仅体外培养的细胞系。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明项目核心数据属于转录组或基因表达层面。本站将其归类为肿瘤 / 乳腺癌，说明该数据集在应用领域上主要服务于肿瘤学、特别是乳腺癌相关研究。
【数据内容】
该数据集收录的是转录组表达谱数据，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。具体数据内容涉及野生型小鼠与 Padi4 缺陷小鼠肺来源三阴性乳腺癌细胞再分离后的表达谱。源站未提供样本数量、测序平台、读长、表达定量方法、差异表达基因列表或具体分析结果等细节。因此，关于数据文件类型、数据量大小、基因表达矩阵或原始测序数据的具体组织形式，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库。项目编号为 1470620。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联合体的生物数据集合，并为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一入口。该项目的具体样本采集方法、小鼠品系背景、细胞分离流程、测序建库方式及实验条件等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤学、乳腺癌研究，尤其是三阴性乳腺癌肺转移与肿瘤微环境相互作用相关的研究方向。由于涉及 Padi4 缺陷小鼠与野生型小鼠的对比，潜在适用场景包括探索 Padi4 基因在肿瘤细胞体内生长、肺定植或转录组重编程中的作用。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明其可用于基因表达层面的比较分析、候选基因筛选或通路层面的探索。但具体适用性需结合项目原始数据与分析设计判断，源站未提供详细说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 1470620 定位该数据集，并借助 BioProject 记录提供的链接查找该项目关联的多种数据类型。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或推荐工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，源站描述仅说明 BioProject 的一般性质，未提供该项目的质量控制指标、样本量、测序深度、重复数、批次效应处理或统计分析方法等信息。因此，无法依据现有信息评估其数据质量或适用范围限制。源站未提供相关质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款。用户如需引用或使用，应参考 NCBI BioProject 页面及项目关联数据所附带的官方说明。源站未提供具体引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1470620
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
转移复发仍是三阴性乳腺癌（TNBC）面临的主要难题。已知肺微环境中的中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）在TNBC的转移定植和生长中发挥关键作用。然而，NETs在急性复发期间决定播散性肿瘤细胞（DTCs）表型可塑性及再激活中的确切作用仍不清楚。本研究利用原位急性复发转移小鼠模型，将4T1细胞移植到野生型或NET缺陷型（Padi4-/-）小鼠中，随后切除原发肿瘤。尽管Padi4缺陷对原发肿瘤的生长没有影响，但显著减少了肺转移并延长了生存期。从野生型小鼠中重新建立的肺源性4T1细胞表现出高度增殖的上皮表型，而从Padi4-/-小鼠中获得的细胞似乎维持静息的间充质状态。至关重要的是，组织适应的NET形成性肺中性粒细胞可通过强烈上调转化生长因子-β（TGF-β）负调控因子，从而减弱自分泌信号，诱导间充质-上皮转化（MET）样转换。
总体而言，我们的研究结果揭示，组织适应的NETs充当关键的肿瘤自主分子开关，协调退出静息状态并驱动转移性生长，突显了其作为TNBC围手术期治疗靶点的前景。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
