免疫抑制性髓系细胞经膜结合TGF-β1机制诱导间质样乳腺癌干细胞 [scRNA-seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1468270），主题为免疫抑制性髓系细胞通过膜结合 TGF-β1 依赖机制诱导间质样乳腺癌干细胞，采用 scRNA-seq 技术，属于转录组或基因表达范畴
![PRJNA1468270: Immunosuppressive myeloid cells induce mesenchymal-like breast cancer stem cells by a membrane-bound TGF-β1-dependent mechanism [scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/70918.jpg)
基本信息
资源简介
免疫抑制性髓系细胞经膜结合TGF-β1机制诱导间质样乳腺癌干细胞 [scRNA-seq]
该数据集为 NCBI BioProject 收录的单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）项目，编号 PRJNA1468270，标题为“Immunosuppressive myeloid cells induce mesenchymal-like breast cancer stem cells by a membrane-bound TGF-β1-dependent mechanism”。其研究主题聚焦于免疫抑制性髓系细胞如何通过膜结合 TGF-β1 依赖机制诱导间质样乳腺癌干细胞，属于肿瘤/乳腺癌方向，主题标签为转录组或基因表达。该数据集以 scRNA-seq 为技术手段，旨在从单细胞层面解析相关细胞群体及其基因表达特征，为理解乳腺癌微环境中免疫抑制与干细胞样表型之间的关联提供转录组数据支持。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号 1468270。BioProject 是围绕某一具体研究计划或项目而汇集的一组生物学数据，通常由单一机构或联盟发起，并为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的标题明确指向一个具体的研究问题：免疫抑制性髓系细胞是否以及如何通过膜结合 TGF-β1 依赖机制，诱导乳腺癌细胞获得间质样干细胞特征。该问题涉及肿瘤免疫微环境、乳腺癌干细胞以及 TGF-β1 信号通路等多个层面的交叉，因此该项目在分类上归属于肿瘤/乳腺癌，并以转录组或基因表达作为主题标签。
【数据内容】
该数据集的核心数据类型为单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据，属于转录组或基因表达范畴。其研究内容围绕免疫抑制性髓系细胞与间质样乳腺癌干细胞之间的诱导关系展开，并强调膜结合 TGF-β1 依赖机制。基于 scRNA-seq 技术，该数据集可用于在单细胞分辨率下观察不同细胞群体的基因表达模式，进而支持对上述生物学过程的探索。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、细胞数、测序平台、数据文件格式或具体分析结果的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1468270。BioProject 记录本身并不直接等同于某一类原始数据文件，而是作为项目层面的索引，帮助用户定位由该项目产生的多种数据类型。该项目的标题和主题标签表明其数据与基因表达转录组相关，并采用 scRNA-seq 技术。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验流程以及测序中心等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与乳腺癌肿瘤免疫微环境、免疫抑制性髓系细胞、乳腺癌干细胞及间质样表型、TGF-β1 信号机制相关的转录组研究场景。具体而言，研究人员可将其用于探索免疫抑制性髓系细胞对乳腺癌细胞基因表达的影响，分析间质样乳腺癌干细胞相关表达特征，或在单细胞层面考察膜结合 TGF-β1 依赖机制的潜在作用。由于主题标签为转录组或基因表达，该数据集也可作为基因表达分析、细胞类型注释或细胞状态比较的参考数据。但需注意，以上适用方向均围绕该项目的标题与主题展开，源站未提供更具体的分析建议或推荐流程。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 入口进行检索与访问，项目编号为 PRJNA1468270。用户可在 BioProject 记录中查找由该项目链接的多种数据类型，并根据自身研究需要进一步获取相关数据。由于源站未提供具体的数据下载格式、处理流程、分析工具或代码，使用时应以 BioProject 页面所提供的信息为准，并结合 scRNA-seq 数据的通用处理原则进行质量控制、比对、定量和下游分析。对于本项目特有的实验设计、分组信息和分析参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于项目层面的记录，其质量与完整性取决于项目提交方所提供的信息。当前可确认的信息包括项目编号、标题、分类、来源站、主题标签以及 scRNA-seq 技术类型。关于样本量、测序深度、细胞存活率、批次效应、数据覆盖率、重复性及验证实验等质量指标，源站未提供。因此，在缺乏具体质量参数的情况下，用户不应假设该数据集在特定分析中具有某种性能水平。此外，该数据集的研究结论涉及特定机制，但源站未提供统计结果或结论细节，使用时应避免超出数据本身进行推断。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA1468270。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明，源站未提供。用户在使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的通用使用条款，并建议直接访问项目页面以获取最新的引用与许可信息。若需在出版物中引用该数据集，应以源站提供的官方引用格式为准；在源站未提供具体引用信息的情况下，不应自行编造引用条目或声称拥有特定授权。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1468270
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
抑制性髓系细胞在癌症逃逸抗肿瘤免疫中发挥核心作用，并具有多种促肿瘤活性，包括促进癌细胞存活、侵袭和转移。近期证据表明，某些亚群还可能影响肿瘤异质性和细胞可塑性。然而，它们在癌症干细胞促进和可塑性中的作用及其潜在分子机制尚未被阐明。在此，我们证明，体外生成或从乳腺癌患者中分离的人免疫抑制性髓系细胞可诱导具有间充质特征的癌症干细胞样细胞。这种诱导癌症干性的功能仅限于表达CD52的髓系亚群。基于单细胞转录组学和表面蛋白质组的相互作用组分析确定，膜结合型TGF-β1是这一效应的潜在介质。对TGF-β1通路的功能性抑制可阻断抑制性髓系细胞诱导干细胞样特征。这些结果为抑制性髓系细胞的促癌症干性能力及其在乳腺癌中的相关分子机制提供了见解。
总体设计：使用FACS Aria II（BD Biosciences）分选三种实验条件下的单细胞进行RNA测序：（1）“对照”条件，单独培养的MCF7或HuMoSC，根据活力进行分选；（2）“肿瘤球”条件，包括用Accumax™（Sigma-Aldrich）解离的三天龄MCF7肿瘤球，或单独在肿瘤球条件下培养3天的HuMoSC，均根据活力进行分选；（3）“共培养”条件，MCF7与HuMoSC共同培养三天，使用Accumax解离，用CD45抗体和活力染料染色后分选。根据前向和侧向散射宽度排除双细胞。分选后的细胞经离心（350×g，4°C，5分钟），用台盼蓝计数，仅在活力超过80%时才进行后续处理。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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