免疫抑制性髓系细胞经膜结合TGF-β1依赖机制诱导间充质样乳腺癌干细胞 [RNA-seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1468259），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤/乳腺癌分类。研究关注免疫抑制性髓系细胞通过膜结合 TGF-β1 依赖机制诱导间充质样乳腺癌干细胞，数据为 RNA-seq 相关生物数据集合
![PRJNA1468259: Immunosuppressive myeloid cells induce mesenchymal-like breast cancer stem cells by a membrane-bound TGF-β1-dependent mechanism [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/70928.jpg)
基本信息
资源简介
免疫抑制性髓系细胞经膜结合TGF-β1依赖机制诱导间充质样乳腺癌干细胞 [RNA-seq]
PRJNA1468259 是一个来自 NCBI BioProject 的转录组或基因表达相关数据集，编号为 1468259，归属于肿瘤 / 乳腺癌分类。该数据集围绕“免疫抑制性髓系细胞通过膜结合 TGF-β1 依赖机制诱导间充质样乳腺癌干细胞”这一研究主题展开，数据类型为 RNA-seq 相关生物数据集合。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将源自同一组织或联盟、围绕单一研究计划产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集因此可作为探索乳腺癌中免疫抑制性髓系细胞、膜结合 TGF-β1 信号机制以及间充质样乳腺癌干细胞之间关系的重要转录组资源，服务于基因表达层面的研究需求。
【数据集背景】
该数据集对应的研究关注免疫抑制性髓系细胞与乳腺癌干细胞之间的相互作用。具体而言，研究主题指向一种机制：免疫抑制性髓系细胞通过膜结合 TGF-β1 依赖的方式，诱导产生间充质样乳腺癌干细胞。这一主题处于肿瘤免疫学与肿瘤干细胞生物学的交叉领域，涉及髓系细胞介导的免疫抑制、TGF-β1 信号传导以及乳腺癌细胞的可塑性或干性获得。数据集以 RNA-seq 为数据形式，属于转录组或基因表达主题，表明其可用于从基因表达角度考察上述生物学过程。该数据集来源于 NCBI BioProject，编号 1468259，本站分类为肿瘤 / 乳腺癌。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达。其数据为 RNA-seq 相关生物数据集合，属于 BioProject 所汇集的一类生物数据。BioProject 记录本身提供用户一个单一入口，用以查找该项目所产生的多样数据类型。就本数据集而言，核心内容围绕 RNA-seq 展开，服务于基因表达层面的分析。关于样本数量、测序平台、读长、覆盖度、具体基因列表、差异表达结果或任何定量指标，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI BioProject 数据库，记录 ID 为 1468259。其英文名称为“PRJNA1468259: Immunosuppressive myeloid cells induce mesenchymal-like breast cancer stem cells by a membrane-bound TGF-β1-dependent mechanism [RNA-seq]”。源站标题为“Immunosuppressive myeloid cells induce mesenchymal... (ID 1468259) - BioProject - NCBI”。源站描述说明，BioProject 是围绕单一研究计划、源自单一组织或联盟的生物数据集合，BioProject 记录为用户提供查找该项目所产生多样数据类型的单一位置。关于具体采集地点、采集时间、实验操作流程、样本处理细节或测序机构，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕肿瘤 / 乳腺癌分类下的机制探索。其研究主题涉及免疫抑制性髓系细胞、膜结合 TGF-β1 依赖机制以及间充质样乳腺癌干细胞，因此可用于与这些方向相关的基因表达分析、转录组数据挖掘或作为同类研究的参考数据集合。由于数据以 RNA-seq 形式呈现，潜在适用方向包括考察不同细胞状态或处理条件下的基因表达变化。但具体适用场景需结合源站提供的原始数据与元数据判断，源站未提供更细化的适用说明。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问，记录 ID 为 1468259。用户可在 BioProject 记录中查找该项目所链接的多样数据类型。关于具体下载方式、数据格式、分析流程、软件工具或参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开生物数据集合记录。其主题标签为转录组或基因表达，数据为 RNA-seq 相关生物数据集合。关于数据质量指标、批次效应、样本量、测序深度、重复数、对照设置或任何验证结果，源站未提供。因此，使用时应以源站记录及其链接的原始数据为准，并自行评估数据适用性。该数据集的研究主题具有特定机制指向，其结论外推需谨慎。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，记录 ID 为 1468259，英文名称中包含 PRJNA1468259。关于具体引用格式、作者列表、发表文献、许可条款或使用限制，源站未提供。使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 源站记录及其关联数据页面所给出的引用与许可信息。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1468259
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
抑制性髓系细胞在癌症逃逸抗肿瘤免疫中发挥核心作用，并具有多种促肿瘤活性，包括促进癌细胞存活、侵袭和转移。近期证据表明，某些亚群还可能影响肿瘤异质性和细胞可塑性。然而，它们在癌症干细胞促进和可塑性中的作用及其潜在分子机制尚未被阐明。在此，我们证明，体外生成或从乳腺癌患者中分离的人免疫抑制性髓系细胞可诱导具有间充质特征的癌症干细胞样细胞。这种诱导癌症干性的功能仅限于表达CD52的髓系亚群。基于单细胞转录组学和表面蛋白质组的相互作用组分析确定，膜结合型TGF-β1是这一效应的潜在介质。对TGF-β1通路的功能性抑制可阻断抑制性髓系细胞诱导干细胞样特征。这些结果为抑制性髓系细胞的促癌症干性能力及其在乳腺癌中的相关分子机制提供了见解。
总体设计：单独培养的MCF7细胞（参考样本/对照组）或与HuMoSC共培养24小时或72小时的MCF7细胞，均设置三个重复，经分选后提取RNA，用于BRB测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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