PRJNA1462819:P3FI-90 激活三阴性乳腺癌先天免疫应答
数据围绕 P3FI-90 激活三阴性乳腺癌先天免疫应答这一研究主题,属于转录组或基因表达层面的生物数据集合,可用于探索三阴性乳腺癌中先天免疫应答相关的基因表达变化

基本信息
资源简介
PRJNA1462819:P3FI-90 激活三阴性乳腺癌先天免疫应答
P3FI-90 activates innate immune responses in tripl... (ID 1462819) - BioProject - NCBI
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1462819),英文标题为 P3FI-90 activates innate immune responses in triple-negative breast cancer,本站归类为肿瘤 / 乳腺癌,主题标签为 Transcriptome or Gene expression。数据围绕 P3FI-90 激活三阴性乳腺癌先天免疫应答这一研究主题,属于转录组或基因表达层面的生物数据集合,可用于探索三阴性乳腺癌中先天免疫应答相关的基因表达变化。源站未提供样本量、物种、测序平台、数据格式与具体分析结论等信息(来源 NCBI)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关、来自单一组织或联盟的生物学数据集合。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用于查找为该项目生成的各类数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1462819
下载信息
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数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1462819
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
免疫治疗已成为癌症治疗中一种有前景的治疗选择,但由于免疫抑制性肿瘤微环境(TME)导致疗效较低,其在三阴性乳腺癌(TNBC)患者中的适用性受到限制。在此,我们发现赖氨酸脱甲基酶3B(KDM3B)是TNBC免疫逃逸的关键介导因子。KDM3B表达与细胞毒性T淋巴细胞(CTL)浸润呈负相关。通过遗传学或药理学手段抑制KDM3B可促进CD8+ T细胞的募集和活化,从而抑制TNBC小鼠模型中的肿瘤生长。机制上,KDM3B通过降低SHP1启动子处的H3K9me2水平来靶向SHP1。抑制KDM3B可减弱SHP1介导的STING失活,从而触发强烈的Ⅰ型IFN应答。引人注目的是,KDM3B缺失以及使用KDM3B选择性抑制剂P3FI-90治疗均显著抑制肿瘤进展,并减轻对免疫检查点阻断(ICB)治疗的耐药性。综上所述,这些发现确立KDM3B是免疫逃逸的关键调控因子,而靶向KDM3B代表了一种有望增强TNBC免疫治疗疗效的策略。
总体设计:对用DMSO对照或P3FI-90处理24小时的4T1细胞进行RNA-seq分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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