PRJNA144829：原发性男性乳腺癌基因表达谱揭示两个独特亚组并确定NAT1为新预后生物标志物

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数据说明

男性乳腺癌（MBC）是一种罕见且特征描述不足的疾病。本研究旨在从转录层面刻画MBC肿瘤的特征，将其归类为全面的亚组，并与女性乳腺癌（FBC）进行比较。方法：采用Illumina Human HT-12珠芯片对66例临床病理学信息完善的MBC新鲜冷冻肿瘤进行分析，并构建了包含220例MBC肿瘤的组织芯片，通过免疫组化进行验证。使用两个外部基因表达数据集进行比较；37例MBC和359例FBC。结果：采用无监督方法，我们将MBC肿瘤分为两个亚组，分别为luminal M1和luminal M2，二者在肿瘤生物学特征和预后方面存在差异，且不同于FBC中描述的内在亚组。这两个亚组在外部MBC数据集中得到了重现。Luminal M2肿瘤的特征是免疫应答基因和与雌激素受体（ER）信号通路相关基因的高表达。

另一方面，管腔M1型肿瘤尽管通过免疫组化检测为ER阳性，但与ER信号相关基因的关联性较低，并表现出更具侵袭性的表型和更差的预后。对两个差异表达最显著的基因——1类人类白细胞抗原（HLA）和代谢基因N-乙酰转移酶-1（NAT1）——的验证分别显示，这两个标志物的高表达与显著更好的生存率相关（HLA，风险比（HR）3.6，P=0.002；NAT1，HR 2.5，P=0.033）。重要的是，NAT1在多变量分析中仍具有显著性（HR 2.8，P=0.040），因此可能是MBC的一个新型预后标志物。结论：我们检测到了两个独特且稳定的MBC亚组，其在肿瘤生物学特征和结局方面存在差异。它们不同于广泛认可的FBC内在亚型。因此，它们可能构成两种新型乳腺癌亚组，仅发生于

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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