PRJNA1432965：哺乳的抗肿瘤效应靶向代谢脆弱性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1432965

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数据说明

哺乳对乳腺癌和卵巢癌具有保护作用，但其机制尚不清楚。Pappalysin-A（PAPP-A）是一种细胞外蛋白酶，通常在妊娠期间表达于胎盘滋养层细胞表面，但也可作为癌基因发挥作用。我们发现，哺乳期小鼠或母乳喂养母亲的血清对PAPP-A+癌症具有特异性保护作用，而未生育小鼠或产次匹配但未哺乳女性的血清则无此作用。RNAseq揭示，哺乳期血清靶向PAPP-A+癌细胞的线粒体功能，导致细胞衰老。此外，我们发现癌细胞中PAPP-A的过表达与较低的线粒体功能相关。这些观察结果表明，哺乳期血清的抗肿瘤效应是通过利用PAPP-A+癌细胞的代谢脆弱性来实现的。我们通过血清蛋白质组学鉴定出促肾上腺皮质激素释放激素（CRH），并证明CRF——CRH的合成形式——单独即可模拟哺乳期血清的效应。

因此，我们的研究揭示了哺乳对癌症保护作用的一种机制，并提出了使用CRF作为治疗手段来模拟或增强哺乳对乳腺癌预防保护作用的可能性。总体设计：过表达PAPP-A的MCF7细胞（见此处PMID 31046834所述）使用matrigel进行3D培养，或用于建立异种移植。培养物在含有10%血清的培养基中生长48小时，血清来自哺乳期（Lac）或非哺乳期（NL）女性。随后将培养物速冻并进行RNAseq分析。每个培养物包含500-700个集落。异种移植在裸鼠中建立10天，然后通过腹腔注射用Lac或NL血清处理小鼠。肿瘤在生长28天后收集并速冻进行RNAseq分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。