PRJNA1431974：ZBTB16基因内含子增强子在ER+乳腺癌AR介导肿瘤抑制中的功能作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1431974

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数据说明

雄激素受体（AR）在雌激素受体阳性（ER⁺）乳腺癌中是一种抑癌因子，可抑制细胞周期基因并限制增殖。我们此前鉴定出ZBTB16为候选的AR调控抑癌基因。在此，我们验证了ZBTB16是AR的直接靶标，并检验其是否介导AR的抑癌活性。在临床队列中，ZBTB16 mRNA表达在乳腺肿瘤中相对于正常组织降低，且较高的表达与ER+疾病生存改善相关。雄激素处理增加了ER+乳腺癌细胞系中的ZBTB16蛋白，但在所测试的模型中，ZBTB16敲低或过表达均未检测到对AR抗增殖效应的改变。在乳腺癌模型和临床标本中，AR结合于ZBTB16基因座内一个保守的内含子3激素应答区域（HRRINT3），并伴有雄激素依赖性的H3K27ac富集，这与AR应答增强子的特征一致。

HRRINT3 CRISPR/Cas9缺失阻止了AR依赖的ZBTB16诱导，削弱了AR介导的生长抑制，减弱了经典AR靶基因的激活，并在乳腺癌和前列腺癌细胞中增加了基线增殖，同时上调了E2F靶点。这些发现表明，HRRINT3是一个在谱系中保守的增强子，参与AR介导的跨AR+癌症的肿瘤抑制作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。