PRJNA1429233：衰老促进 RAGE 依赖的乳腺癌转移增强

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1429233

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数据说明

乳腺癌的发病率和死亡率随年龄增长而增加，但衰老与转移之间的机制尚不清楚。大多数临床前研究使用年轻动物模型，限制了对衰老微环境如何影响癌症的认识。在此，我们证明在多种小鼠模型中，衰老显著增加乳腺癌转移，且这一效应依赖于宿主对晚期糖基化终产物受体（RAGE）的表达。衰老增加了肿瘤RAGE配体水平，包括S100A8/9和AGEs，并诱导肿瘤中炎症、EMT、血管生成和细胞外基质基因程序的RAGE依赖性变化。来自衰老宿主的循环细胞因子和S100A8/9促进肿瘤细胞侵袭，而RAGE或S100A8/9抑制可抑制这一过程。在人类乳腺癌中，AGER表达升高以及衰老和RAGE相关转录特征的富集与较差的生存相关，尤其是在老年患者中。这些发现确定RAGE是衰老与转移之间的机制联系，并可能是老年患者的潜在治疗靶点。

总体设计：对来自野生型和RAGE基因敲除的年轻（3个月大）和老年（21个月大）小鼠的原发性乳腺肿瘤进行RNA-seq分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。