PRJNA1427211:靶向 RNase H2 提升三阴性乳腺癌复制压力、DNA 损伤与抗肿瘤免疫的双机制策略

源站描述显示,三阴性乳腺癌(TNBC)缺乏有效靶向治疗且预后差,TNBC 细胞逃避癌基因诱导的衰老并适应升高的复制压力。研究显示逃避衰老的细胞依赖 RNase H2 过表达,RNASEH2A 在 TNBC 肿瘤中过表达并与不良生存相关;沉默或抑制 RNase H2 可选择性损害 TNBC 活力、抑制

sra
浏览 10
基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1427211: Targeting RNase H2: A Dual Mechanism Strategy to Elevate Replication Stress, DNA Damage, and Antitumor Immunity in Triple-Negative Breast Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

PRJNA1427211:靶向 RNase H2 提升三阴性乳腺癌复制压力、DNA 损伤与抗肿瘤免疫的双机制策略

该数据集来自 NCBI,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题为 Transcriptome or Gene expression。源站描述显示,三阴性乳腺癌(TNBC)缺乏有效靶向治疗且预后差,TNBC 细胞逃避癌基因诱导的衰老并适应升高的复制压力。研究显示逃避衰老的细胞依赖 RNase H2 过表达,RNASEH2A 在 TNBC 肿瘤中过表达并与不良生存相关;沉默或抑制 RNase H2 可选择性损害 TNBC 活力、抑制体内肿瘤生长,并增加复制压力、DNA 损伤和胞质单链 DNA 积累,触发天然免疫激活与 T 细胞招募趋化因子上调,且与 ATR 和 PARP 抑制协同(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):三阴性乳腺癌(TNBC)缺乏有效的靶向治疗且预后差。TNBC 细胞逃避癌基因诱导的衰老并适应升高的复制压力。在此,我们表明逃避衰老的细胞依赖于 RNase H2 的过表达,RNase H2 可去除基因组 DNA 中错误掺入的核糖核苷酸。RNASEH2A 是 RNase H2 的催化亚基,在 TNBC 肿瘤中过表达并与不良生存相关。基因沉默或药理学抑制 RNase H2 可选择性地损害 TNBC 活力,同时不伤害非致瘤性乳腺上皮细胞,并在体内抑制肿瘤生长。机制上,RNase H2 抑制增加复制压力、DNA 损伤和胞质单链 DNA 积累,触发天然免疫激活和 T 细胞招募趋化因子的上调。RNase H2 抑制与 ATR 和 PARP 协同

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1427211

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1427211

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌(TNBC)缺乏有效的靶向治疗,预后较差。TNBC细胞逃避癌基因诱导的衰老,并适应升高的复制应激。在此,我们发现逃避衰老的细胞依赖于RNase H2的过表达,该酶负责清除基因组DNA中错误掺入的核糖核苷酸。RNASEH2A是RNase H2的催化亚基,在TNBC肿瘤中过表达,并与不良生存相关。基因沉默或药理学抑制RNase H2可选择性地损害TNBC细胞活力,同时不影响非致瘤性乳腺上皮细胞,并在体内抑制肿瘤生长。在机制上,抑制RNase H2会增加复制应激、DNA损伤和胞质单链DNA积累,触发先天免疫激活并上调T细胞招募趋化因子。抑制RNase H2与ATR和PARP抑制剂具有协同作用,并增强免疫检查点阻断的疗效。总之,这些发现将RNase H2确定为TNBC的一个治疗脆弱靶点,并支持整合DNA损伤调节与免疫治疗的联合策略。

总体设计:野生型MDA-MB-231及其RNASEH2A敲除衍生物的RNAseq图谱

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案