PRJNA1425499：循环microRNA结合流行病学因素提升乳腺癌亚型检测的筛查阶段 [miRNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1425499

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对MCC-Spain研究中招募的40名女性（30例乳腺癌病例和10例对照）血清样本中循环miRNA的探索性小RNA测序分析。总体设计：血清样本在治疗前采集。提取总RNA，使用QIAseq miRNA Library Kit制备小RNA文库，并在Illumina NextSeq 500平台上测序。提供了处理后的miRNA水平计数数据。该筛选阶段用于候选生物标志物的选择，并排除在验证分析之外。分组：A（对照组）、B（筛选组）、C（无病生存组）和D（非无病生存组）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。