PRJNA1423213:乳腺癌血清 tsRNA-Gly-5-0006 差异表达及其对癌细胞生物学的影响
该数据集来自 NCBI,聚焦乳腺癌中 tRNA 衍生小 RNA 片段(tRFs)的潜在诊断与功能价值。研究通过高通量测序及临床队列验证,发现 tsRNA-Gly-5-0006 在乳腺癌组织与患者血清中较癌旁正常组织、乳腺炎样本及健康对照显著下调,并在乳腺癌细胞系 MDA-MB-231 中过表达后观察

基本信息
资源简介
PRJNA1423213:乳腺癌血清 tsRNA-Gly-5-0006 差异表达及其对癌细胞生物学的影响
该数据集来自 NCBI,聚焦乳腺癌中 tRNA 衍生小 RNA 片段(tRFs)的潜在诊断与功能价值。研究通过高通量测序及临床队列验证,发现 tsRNA-Gly-5-0006 在乳腺癌组织与患者血清中较癌旁正常组织、乳腺炎样本及健康对照显著下调,并在乳腺癌细胞系 MDA-MB-231 中过表达后观察细胞表型。数据可用于乳腺癌差异表达分析、非侵入性生物标志物筛选及 tsRNA 功能研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):乳腺癌(BC)是全球女性死亡的主要原因之一,这在很大程度上归因于转移进展以及缺乏可靠的用于早期检测的非侵入性生物标志物。本研究探讨了 tRNA 衍生小 RNA 片段(tRFs)作为 BC 新型诊断和功能分子的潜力。通过高通量测序及随后在临床队列中的验证,我们发现与癌旁正常组织、乳腺炎样本和健康对照相比,tsRNA-Gly-5-0006 在 BC 组织和患者血清中均显著下调。总体设计:tsRNA-Gly-5-0006 在乳腺癌组织中显著偏低,并统计了乳腺癌患者与正常对照组之间 tsRNA-Gly-5-0006 表达的差异。在乳腺癌细胞系 MDA-MB-231 中过表达 tsRNA-Gly-5-0006,观察细胞表型
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1423213
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
乳腺癌(BC)是全球女性死亡的主要原因之一,这在很大程度上归因于转移进展以及缺乏可靠的用于早期检测的非侵入性生物标志物。本研究探讨了tRNA衍生的小RNA片段(tRFs)作为BC中新型诊断和功能分子的潜力。通过高通量测序及随后在临床队列中的验证,我们发现与癌旁正常组织、乳腺炎样本和健康对照相比,tsRNA-Gly-5-0006在BC组织和患者血清中均显著下调。总体设计:tsRNA-Gly-5-0006在乳腺癌组织中显著偏低,统计乳腺癌患者与正常对照组之间tsRNA-Gly-5-0006表达的差异。在乳腺癌细胞系MDA-MB-231中过表达tsRNA-Gly-5-0006,观察细胞表型
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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