CD1d-KO与WT小鼠E0771乳腺癌髓系细胞单细胞RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1415717

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

髓系细胞在癌症进展中发挥关键作用，影响肿瘤生长、转移和对免疫治疗的反应。肿瘤浸润髓系细胞高度异质，其功能从抗肿瘤到促肿瘤不等。塑造这些细胞群体的机制仍知之甚少，并可能提供治疗机会。在本研究中，我们将脂质呈递分子CD1d鉴定为肿瘤微环境中肿瘤进展和髓系异质性的调控因子。CD1d缺陷小鼠在乳腺癌模型中表现出肿瘤生长减少和免疫浸润改变。类似地，用抗体靶向CD1d可抑制肿瘤生长、重塑髓系格局，并提高抗PD-1免疫治疗疗效。CD1d对髓系细胞功能分化的依赖性调控是细胞内在的，并在人类和小鼠中保守。单细胞RNA测序揭示，来自CD1d-KO动物的肿瘤中促炎程序增强，炎性单核细胞积聚。随后，我们构建了一个CD1d-KO相关基因特征，可预测乳腺癌患者的临床结局和免疫治疗反应。

因此，可以以CD1d为靶点，改变肿瘤浸润性髓系细胞群体，从而增强免疫疗法的应答。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。