PRJNA1412757：葡萄糖与谷氨酰胺解偶联正交代谢状态独立维持癌细胞存活

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1412757

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数据说明

癌症代谢常被描述为依赖葡萄糖-谷氨酰胺协同燃料；然而，不同营养物质是否强制形成离散的代谢状态仍不清楚。葡萄糖利用通常在Warburg生理学下解释，涉及糖酵解加速和TCA顺时针旋转以产生还原当量；然而，新出现的证据表明，谷氨酰胺在某些条件下可以驱动独立于糖酵解的补充途径，涉及与大量脂质生物合成相关的TCA逆时针旋转。在此，我们试图确定在MDA-MB-231乳腺癌细胞中，葡萄糖和谷氨酰胺如何独立调控适应性代谢状态，而非作为协同共燃料发挥作用。简言之，细胞在四种确定的营养条件下培养——完全（+Glc,+Gln）、缺乏（−Glc,−Gln）、仅葡萄糖和仅谷氨酰胺——并应用转录组学、代谢组学和脂质组学分析来解析营养强制形成的转录和代谢状态。

总体设计：对在四种特定营养条件下培养的MDA-MB-231乳腺癌细胞进行RNA-seq——完全条件（+葡萄糖，+谷氨酰胺）、缺乏条件（−葡萄糖，−谷氨酰胺）、仅葡萄糖和仅谷氨酰胺——并得到代谢组学和脂质组学变化证据的支持。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。