基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

ER阳性转移性乳腺癌CDK4/6抑制剂治疗的外泌体miRNA图谱

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1395502），英文名称为“Exosomal miRNA profiling in ER-positive metastatic breast cancer treated with CDK4/6 inhibitors”。从名称可以看出，其研究主题聚焦于雌激素受体阳性（ER 阳性）转移性乳腺癌患者在接受 CDK4/6 抑制剂治疗后，外泌体 miRNA 的表达谱分析。该数据集归属于肿瘤 / 乳腺癌分类，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。作为 BioProject 体系中的一项记录，它为研究者提供了一个集中入口，用以发现和链接该项目所产生的多种数据类型。整体而言，该数据集围绕 ER 阳性转移性乳腺癌的 CDK4/6 抑制剂治疗场景，以外泌体 miRNA 为分析对象，属于肿瘤转录组学与液体活检交叉方向的数据资源。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1395502。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物学数据，这些数据通常来自一个机构或一个联盟。一个 BioProject 记录为用户提供了一个统一的位置，以便找到该项目所生成的不同类型数据的链接。该项目的标题明确指出其研究背景为 ER 阳性转移性乳腺癌在接受 CDK4/6 抑制剂治疗后的外泌体 miRNA 表达谱分析。ER 阳性转移性乳腺癌是乳腺癌的一种亚型，CDK4/6 抑制剂是其治疗中常用的一类药物。外泌体 miRNA 作为液体活检的潜在标志物，在肿瘤治疗反应监测和耐药机制研究中受到关注。该数据集即在这一背景下产生，旨在通过转录组或基因表达层面的数据，刻画治疗相关的外泌体 miRNA 变化。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。结合数据集名称，具体分析对象为外泌体 miRNA 的表达谱。miRNA 是一类短小的非编码 RNA，参与基因表达调控；外泌体中的 miRNA 可反映来源细胞的生理或病理状态。因此，该数据集的内容应涉及 ER 阳性转移性乳腺癌患者在 CDK4/6 抑制剂治疗背景下，外泌体 miRNA 的表达检测结果。然而，关于样本数量、测序平台、具体 miRNA 列表、表达量矩阵、差异表达分析结果等细节，源站未提供。该数据集在 NCBI BioProject 中的记录主要起到项目索引和链接作用，具体数据文件需通过项目页面进一步获取。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心。项目以 BioProject 形式组织，ID 为 1395502。BioProject 记录本身并不一定直接包含所有原始数据，而是提供指向不同数据类型的链接。关于样本采集的具体地点、时间、机构、患者纳入标准、伦理审批信息、样本处理流程、外泌体分离方法、miRNA 测序或检测平台等，源站未提供。因此，无法从现有信息中确定该数据集的具体采集细节和实验流程。

【适用场景】

该数据集适用于与 ER 阳性转移性乳腺癌、CDK4/6 抑制剂治疗、外泌体 miRNA 表达谱相关的研究场景。例如，研究者可能利用该数据探索治疗前后外泌体 miRNA 的变化，寻找潜在的治疗反应标志物或耐药相关 miRNA；也可能将其用于转录组或基因表达层面的二次分析，或与其他乳腺癌数据集进行整合比较。此外，由于涉及外泌体 miRNA，该数据集也可能对液体活检方法学、循环生物标志物发现等方向具有参考价值。但具体适用性需结合项目实际产生的数据内容和实验设计来判断，源站未提供详细说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1395502）进行访问。用户通常可以在 BioProject 页面中找到指向相关数据类型的链接，例如 SRA、GEO 或其他 NCBI 资源。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具和流程，源站未提供。使用时应遵循 NCBI 相关资源的一般使用规范，并注意项目页面中可能列出的数据访问条件。由于该记录本身是项目索引，实际分析前需要获取并理解其关联的原始数据或处理后数据。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库中的项目记录。BioProject 作为项目汇总入口，其质量取决于提交方提供的信息和关联数据的完整性。当前可获取的信息仅限于项目标题、分类、主题标签和来源站描述，缺乏样本量、实验设计、测序深度、数据预处理方法、统计分析方法等关键细节。因此，无法对该数据集的质量进行充分评估。此外，该数据集聚焦于 ER 阳性转移性乳腺癌和外泌体 miRNA，其结论可能不适用于其他乳腺癌亚型或其他治疗背景。源站未提供关于数据限制的更多说明。

【引用与许可】

该数据集的引用方式应参考 NCBI BioProject 的标准引用格式，并注明项目 ID 1395502。关于该数据集的具体许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。用户在使用时应查阅 NCBI 网站的相关政策以及项目页面中可能列出的许可声明。由于源站未提供明确的许可信息，建议在引用或使用前直接访问 NCBI BioProject 记录以获取最新和准确的引用与许可要求。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315252

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1395502

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了在接受一线细胞周期蛋白依赖性激酶4/6抑制剂（CDK4/6i）联合内分泌治疗的雌激素受体阳性（ER+）、HER2阴性转移性乳腺癌患者中循环外泌体microRNA的表达情况。在治疗开始时采集血浆样本，分离外泌体，并采用微阵列技术进行无偏microRNA表达谱分析。根据基线时的内分泌敏感性和CDK4/6抑制下的进展状态对患者进行临床分层。所生成的数据集作为探索性发现队列，用于识别与治疗结果和耐药相关的候选外泌体microRNA。这些数据为研究CDK4/6抑制剂应答背景下的microRNA程序提供了资源。总体设计：本研究设计为对ER阳性、HER2阴性转移性乳腺癌（n=26）血浆来源外泌体microRNA的探索性发现分析。在基线时、即开始CDK4/6抑制剂联合内分泌治疗之前获取血浆样本。

从血浆中分离外泌体，并提取总RNA（包括小RNA），用于microRNA微阵列分析。根据治疗开始时临床定义的内分泌敏感性对患者进行分组。通过差异表达分析，识别与早期进展和耐药相关表型相关的microRNA。随后，从该发现数据集中涌现的候选microRNA被优先选择，在独立分析中进行靶向验证。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别