PRJNA1395058：核FGF2、雄激素受体与Wnt通路激活定义抗孕激素耐药Luminal乳腺癌可靶向亚群

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1395058

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们使用经工程化改造以过表达FGF2的PR+ T47D和T47D-YA细胞系，研究FGF2驱动的抗孕激素耐药。我们进行了转录组分析、qRT-PCR、免疫组织化学和体内实验，以评估激素受体表达、通路改变及治疗反应。我们评估了管腔型乳腺癌标本中的核雄激素受体（AR）和FGF2。RNA-seq显示，FGF2过表达导致Wnt信号通路失调，下调雌激素受体（ER）和PR，并上调AR表达。PR亚型B（PRB）多于亚型A，这与抗孕激素耐药表型一致。过表达FGF2的异种移植瘤显示出抗孕激素耐药、增殖增加和肺转移。阻断AR和Wnt通路可抑制肿瘤生长，联合治疗进一步减少了肿瘤和转移负荷。在临床样本中，核FGF2与ER+PR−和PRB高表达肿瘤中AR水平升高相关。总体设计：从过表达18或22.5 kDa FGF2亚型的T47D-YA细胞以及空载体对照（MOCK）中分离总RNA，用于进一步RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。