PRJNA1389474：乳腺癌揭示BMPR2相关肺动脉高压易感性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1389474

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数据说明

背景：肺动脉高压（PAH）与乳腺癌对女性的影响尤为显著。骨形态发生蛋白受体2型（BMPR2）突变是遗传性PAH最常见的遗传病因，同时具有抑癌功能，但其在连接这两种疾病中的作用仍不明确。方法：我们结合了生物信息学、流行病学和实验方法。挖掘公共癌症数据集以寻找BMPR2改变。在体内，评估了雌性Bmpr2⁺/Δ71大鼠在有无致癌物（DMBA）暴露情况下的乳腺肿瘤发生和肺血流动力学。将肺动脉平滑肌细胞（PASMCs）暴露于肿瘤条件培养基以检测炎症性增殖。最后，在法国国家医疗保健数据库（>9,000例PAH患者）中检查了乳腺癌与PAH之间的关联。结果：BMPR2表达在人乳腺肿瘤中显著降低，并鉴定出反复出现的体细胞变异和深度缺失。Bmpr2⁺/Δ71大鼠出现自发性乳腺肿瘤，并且在DMBA暴露后，发展为加重的肺动脉高压，伴有血管重塑和炎症增加。

荷瘤Bmpr2⁺/Δ71大鼠表现出肺IL-1β和NF-κB活化升高。在体外，Bmpr2⁺/Δ71肿瘤的条件培养基通过IL-1β依赖性信号诱导Bmpr2⁺/Δ71 PASMCs增殖，而中和IL-1β可减弱这一效应。携带BMPR2突变的人PASMCs同样表现出IL-1β诱导的增殖增强。在流行病学上，与一般人群相比，PAH患者的乳腺癌发病率增加了一倍以上，而乳腺癌患者中PAH的发病率增加了近九倍，表明存在双向关系。结论：这些发现确定了乳腺癌与PAH之间由缺陷的BMPR2信号传导和肿瘤相关炎症介导的相互关联。乳腺癌可能作为“二次打击”揭示BMPR2相关的易感性

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。