BRCA1或BRCA2突变筛查患者血清与血浆microRNA表达比较分析数据集1
数据覆盖血清和血浆两种样本类型的microRNA表达谱，可用于比较两种样本中microRNA表达差异、探索与BRCA1/BRCA2突变筛查相关的表达特征，并为乳腺癌遗传风险评估的分子标志物研究提供转录组层面的数据基础（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
BRCA1或BRCA2突变筛查患者血清与血浆microRNA表达比较分析数据集1
PRJNA1272853 是一个聚焦于 microRNA 表达比较分析的研究项目数据集，全称为“Comparative Analysis of microRNA Expression in Serum and Plasma in Patients Screened for BRCA1 or BRCA2 Mutations - dataset 1”。该数据集围绕接受 BRCA1 或 BRCA2 突变筛查的患者群体，对血清与血浆两种样本类型中的 microRNA 表达谱进行对比研究，属于肿瘤/乳腺癌领域，主题标签为转录组或基因表达。其核心价值在于为比较血清和血浆中 microRNA 的表达差异、探索与 BRCA1/BRCA2 突变筛查相关的表达特征提供数据基础，并服务于乳腺癌遗传风险评估相关的分子标志物研究。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集的一组生物学数据，这些数据通常来自单一机构或某一联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集即属于这样一个项目记录下的数据集合，其研究背景聚焦于接受 BRCA1 或 BRCA2 突变筛查的患者，并针对血清与血浆两种样本类型开展 microRNA 表达的比较分析。本站将其归类于肿瘤/乳腺癌方向，主题标签为转录组或基因表达，说明其数据性质属于基因表达层面的转录组数据。
【数据内容】
该数据集覆盖血清和血浆两种样本类型的 microRNA 表达谱。其研究目标在于比较这两种样本类型中 microRNA 的表达差异，并探索与 BRCA1/BRCA2 突变筛查相关的表达特征。从数据主题看，它属于转录组或基因表达范畴，可为乳腺癌遗传风险评估的分子标志物研究提供转录组层面的数据基础。关于具体的样本数量、microRNA 种类数、表达矩阵规模、测序平台或检测方法等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 记录，项目编号为 1272853。其数据来自围绕单一研究计划所汇集的生物学数据，该计划源自单一机构或联合体。关于样本采集的具体时间、地点、受试者招募标准、伦理审批信息以及实验操作流程等，源站未提供。
【适用场景】
基于其数据内容，该数据集可用于以下方向：比较血清与血浆两种样本类型中 microRNA 的表达差异；探索与 BRCA1/BRCA2 突变筛查相关的 microRNA 表达特征；为乳腺癌遗传风险评估的分子标志物研究提供转录组层面的数据基础。此外，作为转录组或基因表达主题的数据集，它也可服务于与 microRNA 表达谱相关的比较分析研究。关于更具体的适用场景或已验证的应用案例，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 BioProject 的统一入口查找该项目所产生的多种数据类型及相关链接。关于数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或代码等具体使用指引，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录下的数据集合，其描述强调 BioProject 作为单一研究计划数据汇集入口的作用。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量大小、技术重复、平台偏好或任何已知局限性，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1272853，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1272853
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集旨在评估人体血清与血浆中miRNA表达的一致性。使用测序技术对两种生物材料中的miRNA表达进行了定量。通过差异表达和相关性分析，评估血浆与血清中miRNA丰度的异同。同时，对这些样本的一个子集进行了qPCR miRNA定量，其结果属于向GEO提交的另一份独立数据。该数据集的生成得到了Gray Foundation资助项目“循环microRNA用于评估BRCA基因之外的风险及高危家族中乳腺癌的早期检测”（授予Dipanjan Chowdhury）以及波兰国家研究中心OPUS资助项目“循环microRNA生物标志物在具有高家族性或遗传性癌症风险患者中的预测潜力”（2023/49/B/NZ5/03835，授予Wojciech Fendler）的支持。总体设计：实验在30对同时采集的人血清和血浆样本中进行。每个样本标题标明患者，因此可以识别样本对。
所有样本均来自健康女性，但其中一些携带了生殖系BRCA1/2突变，因为该实验是一项更大研究的一部分，该研究探讨由BRCA突变或BRCA相关癌症（尤其是卵巢癌和乳腺癌）的存在所引起的miRnome变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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