PRJNA1251083：TRPV4 通道对集合淋巴管收缩功能的调控
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1251083），主题为 TRPV4 通道对集合淋巴管收缩功能的调控，属于转录组或基因表达类数据
基本信息
资源简介
PRJNA1251083：TRPV4 通道对集合淋巴管收缩功能的调控
PRJNA1251083 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学研究项目，其完整英文名称为“Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels”，中文可译为“TRPV4 通道对集合淋巴管收缩功能的调控”。该项目在分类上归属于肿瘤／乳腺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达类数据。从标题和主题标签可以看出，该数据集围绕 TRPV4 通道在集合淋巴管收缩功能调控中的作用展开，所生成的数据类型属于基因表达层面的生物学数据。BioProject 作为 NCBI 提供的项目级记录，旨在为用户提供一个统一入口，以便查找同一研究计划下产生的多种类型数据。该数据集适合关注淋巴管生理调控机制、TRPV4 通道功能以及乳腺癌相关肿瘤生物学的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1251083。其研究主题聚焦于 TRPV4 通道对集合淋巴管收缩功能的调控。集合淋巴管是淋巴系统中负责推动淋巴液回流的管状结构，其收缩功能对维持淋巴运输具有重要意义。TRPV4 是一种离子通道，参与多种生理过程的调节。该 BioProject 记录将围绕这一调控关系所产生的研究数据集中收录，便于用户从单一入口获取与该研究计划相关的各类数据链接。本站将其归类于肿瘤／乳腺癌方向，说明该研究可能与肿瘤尤其是乳腺癌背景下的淋巴管功能研究存在关联。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达类型。这意味着项目所产生的数据可能涉及基因表达水平的检测结果。除主题标签所指示的数据类型外，关于具体样本数量、测序平台、基因列表、表达量数值等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的 BioProject 数据库。BioProject 是一个生物学数据集合，用于收录与单一研究计划相关的数据，这些计划通常来自单一组织或联合体。BioProject 记录为用户提供统一位置，以查找该项目所产生的多种数据类型。关于本项目的具体采集方法、实验设计、样本来源及处理流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是涉及 TRPV4 通道与集合淋巴管收缩功能调控关系的研究。由于本站将其分类为肿瘤／乳腺癌，该数据集也可能适用于乳腺癌相关淋巴管功能及肿瘤微环境研究的参考。此外，对淋巴管生理机制、离子通道调控以及基因表达数据分析感兴趣的研究人员，也可将该数据集作为项目级入口，进一步查找其关联的数据资源。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 1251083 或项目英文名称进行检索，进入该项目的记录页面。BioProject 记录提供统一入口，用户可在其中找到指向该项目所产生各类数据的链接。关于数据下载方式、分析流程、软件工具及具体操作步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于项目级记录，其描述说明 BioProject 用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据。关于该数据集的数据质量评估、样本量、技术重复、数据完整性及使用限制等信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1251083。关于该数据集的引用格式、许可条款及使用授权信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1251083
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：TRPV4介导的信号传导失调与炎症和组织纤维化相关，而这两者都是淋巴系统疾病病理生理学的关键特征；然而，淋巴TRPV4通道的表达和功能作用在很大程度上仍未被探索。方法：我们从显微切割的小鼠集合淋巴管中生成了单细胞RNA测序数据集，以表征Trpv4的表达。使用一种新的Trpv4fx/fx小鼠品系以及Cre品系Prox1-CreERT2和LysM-Cre，我们分别评估了TRPV4通道在淋巴管内皮细胞（LECs）和淋巴管周围髓系细胞中的作用。我们采用了共聚焦显微镜以及对分离并加压的淋巴管进行的大量功能实验，包括细胞内钙活性测量，以验证我们的scRNAseq发现并阐明潜在机制。临床意义通过乳腺癌相关淋巴水肿（BCRL）患者的活检进行了评估。结果：我们表征了集合淋巴管及周围组织的单细胞转录组。
TRPV4在LECs和一部分呈现组织驻留特征的Lyve1+巨噬细胞中高度富集。在临床样本中，BCRL与共表达LYVE1和TRPV4的巨噬细胞浸润增加有关。TRPV4通道的药理学激活导致离体集合淋巴管的收缩失调。这种反应是多相的，包括初始的血管痉挛以及随后的血管舒张和收缩抑制，这与TRPV4+髓系细胞分泌的前列腺素类物质激活淋巴管平滑肌细胞(LMCs)中的血栓素A2受体(TXA2Rs)有关，并且来自LECs的一氧化氮(或许还有其他血管舒张性前列腺素类物质)增加。TXA2R介导的血管痉挛是由于通过IP3受体和钙库操纵性钙内流导致细胞内钙库钙动员增加所致。结论
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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