PRJNA1101442：IMPDH2 调控三阴性乳腺癌治疗反应与化疗耐药

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1101442

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）是乳腺癌中最致命的亚型之一，其高复发率往往源于对化疗产生耐药性。在此，我们在不同的TNBC模型中鉴定出次黄嘌呤核苷酸脱氢酶2（IMPDH2）是阿霉素耐药的促成因素。对公共数据集的分析显示，IMPDH2表达升高与临床中TNBC总体预后较差相关，包括辅助/新辅助治疗后无复发生存期较短。重要的是，在多个阿霉素耐药的TNBC模型中，无论是体外还是体内，通过基因敲除或药物抑制IMPDH2均可导致促肿瘤表型的减少。总体而言，我们提出IMPDH2作为一种新的脆弱靶点，可用于治疗性地抑制和/或预防化疗耐药病灶的生长。总体设计：为研究IMPDH2的作用，我们建立了阿霉素耐药的MDA-MB-231细胞，随后使用短发夹RNA（shRNA）敲低IMPDH2。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。