phs001265:DRIVE 乳腺癌 OncoArray 基因型数据

数据以病例对照与家系设计为特征,主题标签包括 Case-Control 和 Family。可用于乳腺癌相关的遗传关联分析、病例对照比较以及家系层面的研究,帮助识别与乳腺癌风险相关的基因型模式(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case-Control, Family
phs001265: DRIVE Breast Cancer OncoArray Genotypes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs001265:DRIVE 乳腺癌 OncoArray 基因型数据

phs001265: DRIVE Breast Cancer OncoArray Genotypes 是一个以乳腺癌为主题的遗传学数据集,归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在源站被描述为 dbGaP study,采用病例对照与家系设计,主题标签包括 Case-Control 和 Family。整体来看,它围绕乳腺癌相关的基因型信息展开,可用于遗传关联分析、病例对照比较以及家系层面的研究,帮助识别与乳腺癌风险相关的基因型模式。该数据集的核心特征在于将病例对照设计与家系信息结合,为探索乳腺癌遗传易感性提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP study。其英文名称为 phs001265: DRIVE Breast Cancer OncoArray Genotypes,本站分类为肿瘤 / 乳腺癌。源站描述将其界定为 Case-Control, Family,主题标签同样包括 Case-Control 和 Family。从这些信息可以看出,该数据集处于乳腺癌遗传学研究的数据资源范畴,依托 dbGaP 这一平台进行组织与发布。其设计同时涵盖病例与对照的比较,以及家系层面的信息,这使其区别于单纯的病例系列或仅含病例对照的数据集。关于该数据集的具体研究项目背景、发起机构、研究目的等更详细内容,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Case-Control 和 Family,源站描述为 dbGaP study (Case-Control, Family)。据此可知,其数据内容围绕病例对照设计与家系设计展开,涉及乳腺癌相关的基因型信息。数据集名称中包含 OncoArray Genotypes,表明其与 OncoArray 基因分型相关。可用于乳腺癌相关的遗传关联分析、病例对照比较以及家系层面的研究,帮助识别与乳腺癌风险相关的基因型模式。关于具体的样本数量、基因位点数量、变异类型、家系规模、病例与对照的具体构成比例等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study,设计类型为 Case-Control, Family。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站分类为肿瘤 / 乳腺癌。除上述来源与设计信息外,关于样本采集方式、采集时间、采集地点、纳入与排除标准、伦理审批信息、数据生成平台的具体型号与流程等,源站未提供。

【适用场景】

根据源站描述与主题标签,该数据集适用于乳腺癌相关的遗传关联分析、病例对照比较以及家系层面的研究,帮助识别与乳腺癌风险相关的基因型模式。其病例对照与家系设计特征,使其可用于比较病例组与对照组之间的基因型分布差异,也可在家庭内部结构下考察遗传模式。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性、是否适合特定人群或特定亚型分析等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP study。关于数据的具体获取方式、访问权限申请流程、下载格式、配套分析工具、数据处理步骤、质量控制流程以及推荐的分析方法等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集在源站被描述为 dbGaP study,设计类型为 Case-Control, Family。关于数据质量指标、缺失率、基因分型准确性、样本重复性、群体分层情况、批次效应、数据版本更新情况以及使用中的具体限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP study。关于引用格式、许可条款、使用协议、数据共享限制以及二次分发规定等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001265

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control, Family).

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