代谢组学数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.15131/shef.data.21608490.v1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

代谢组学数据集如下：代谢组学MDA CAF-CDM vs 塑料：对在氨基酸饥饿条件下培养6天的乳腺癌细胞（MDA-MB-231）中提取的代谢物进行非靶向代谢组学分析，这些细胞生长在塑料或癌症相关成纤维细胞（CAF）生成的细胞衍生基质上。代谢组学MDA coll vs 塑料：MDA-MB-231乳腺癌细胞在氨基酸饥饿条件下，在I型胶原或塑料上生长6天。非靶向代谢组学数据集。代谢组学CA1胶原 vs 塑料：对在氨基酸饥饿条件下培养6天的乳腺癌细胞（MCF10CA1）中提取的代谢物进行非靶向代谢组学分析，这些细胞生长在塑料或I型胶原上。代谢组学matrigel MDA：将MDA-MB-231细胞接种于matrigel或塑料上，并在氨基酸饥饿条件下生长6天。提取代谢物并通过非靶向质谱进行分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。