MAF扩增赋予Estrogen Receptor Alpha驱动乳腺癌转移的能力

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题围绕MAF扩增如何通过Estrogen Receptor Alpha驱动乳腺癌转移

omicsdi
浏览 3
基因组分类Estrogen signalingBreast cancerMetastasisMaf
MAF amplification licenses Estrogen Receptor Alpha to drive breast cancer metastasis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

MAF扩增赋予Estrogen Receptor Alpha驱动乳腺癌转移的能力

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题围绕MAF扩增如何通过Estrogen Receptor Alpha驱动乳腺癌转移。源站描述指出,MAF扩增增加乳腺癌转移风险,其机制尚不明确但具有重要临床意义;雌激素受体阳性乳腺癌依赖雌激素维持早期生长,并最终以未知机制支持转移。研究整合蛋白质组学、(表观)基因组学及来自人类与同源乳腺癌小鼠模型的功能实验,显示MAF直接与ERalpha相互作用,促进有利于ER+乳腺癌细胞转移扩散的独特染色质状态,并鉴定出一组在EERa2暴露后以MAF依赖方式从头获得许可的促转移基因,包括影响细胞身份建立且已知参与转移起始的因子(如SOX9)以及骨调节因子(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):MAF扩增通过尚不清楚的机制增加乳腺癌(BCa)转移风险,但具有重要的临床意义。与雌激素(E2)依赖相关的雌激素受体阳性(ER+)BCa维持早期乳腺癌的生长,但最终以未知机制支持转移。在此,我们整合了来自人类和同源BCa小鼠模型的蛋白质组学、(表观)基因组学和功能实验,表明MAF直接与ERalpha相互作用,从而促进一种有利于ER+ BCa细胞转移扩散的独特染色质状态。事实上,我们鉴定出一组在EERa2暴露后以MAF依赖方式从头获得许可的促转移基因。在这些基因中,我们发现了影响细胞身份建立且已知在转移起始中发挥作用的因子(例如SOX9),以及骨的调节因子

【主题与分类】

主题标签:Estrogen signaling、Breast cancer、Metastasis、Maf。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD035936

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD035936

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MAF扩增通过尚未充分了解的机制增加乳腺癌(BCa)转移风险,但具有重要的临床意义。与雌激素(E2)依赖性相关的雌激素受体阳性(ER+)BCa维持早期乳腺癌的生长,但最终通过未知机制支持转移。在此,我们整合了来自人类和同系BCa小鼠模型的蛋白质组学、(表观)基因组学和功能分析,表明MAF直接与ERalpha相互作用,从而促进一种独特的染色质状态,有利于ER+ BCa细胞的转移扩散。事实上,我们鉴定了一组在EERa2暴露后以MAF依赖性方式从头获得许可的转移促进基因。在这些基因中,我们发现了影响细胞身份建立且已知在转移起始中发挥作用的因子(例如SOX9),以及骨基质的调节因子,它们最终有助于准备骨转移“土壤”(例如FGF18、PTHLH和JAG1)。促进MAF/E2基因集表达的表观基因组重塑的核心是组蛋白去甲基化酶KDM1A。

确实,KDM1A活性的丧失可阻止MAF/E2介导的BCa转移。综上所述,我们在此揭示了MAF/E2介导转移的分子框架,并证明遗传、表观遗传及激素系统性信号在BCa细胞中整合,决定其转移成功与否,进而影响患者预后。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。