人类乳腺癌新型抗血管生成靶点识别数据集
基于人类乳腺癌基因表达数据，用于识别新型抗血管生成靶点的数据集。
基本信息
资源简介
人类乳腺癌新型抗血管生成靶点识别数据集
【一句话概览】
本数据集是 BioStudies 公开的组学数据集，主题涵盖 transcription profiling by array、Homo sapiens，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Identifying novel anti-angiogenic targets in human breast cancer》。
【数据内容】
源站原始描述：We analysed gene expression in normal breast blood vessels and breast invasive ductal carinoma blood vessels. Normal breast sections and IDC breast sections were immunostained for endothelial-specific CD31. Vessels were dissected and captured with laser capture microscopy, and RNA was extracted and analysed on an Affymetrx array chip. In total, gene expression in blood vessels from 3 normal breast and 3 IDC breast was analysed
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：我们分析了正常乳腺血管和乳腺浸润性导管癌（IDC）血管中的基因表达。对正常乳腺切片和IDC乳腺切片进行内皮特异性CD31免疫染色。用激光捕获显微切割术分离并捕获血管，提取RNA，并在Affymetrx阵列芯片上进行分析。总共分析了来自3例正常乳腺和3例IDC乳腺的血管中的基因表达。
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-31138
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-31138
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
