通过分泌组分析鉴定乳腺癌侵袭驱动因素：CTGF信号洞察

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD021539

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤微环境一致性的改变促进肿瘤向转移进展。在此，我们结合质谱分泌组和蛋白质组分析数据与间充质转化乳腺癌细胞（MCF-7-EMT）的微阵列数据，以阐明上皮-间充质转化（EMT）和细胞侵袭的驱动因素。抑制结缔组织生长因子（CTGF）可减少二维和三维侵袭实验中的侵袭，以及转化生长因子-β诱导蛋白ig-h3（TGFBI）、锌指E盒结合同源盒1（ZEB1）和赖氨酰氧化酶（LOX）的表达，而间充质转化乳腺癌细胞中细胞-细胞外基质（ECM）的黏附增加。相反，CTGF表达增强会导致三维侵袭增加，纤连蛋白1（FN1）、富含酸性分泌蛋白和半胱氨酸（SPARC）及CD44的表达增加，以及细胞ECM黏附减少（图1）。促性腺激素释放激素（GnRH）激动剂曲普瑞林以Ras同源家族成员A（RhoA）依赖的方式降低CTGF表达。

我们的结果表明，CTGF在体外促进乳腺癌细胞侵袭，因此可能成为药物开发中一个有吸引力的治疗靶点，用以防止乳腺癌的扩散。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。