原发灶不明疑似肺癌伴淋巴结及胸膜病变的乳腺癌既往患者基因组与转录组测序数据

该数据集来自ega-archive.org,为BC Cancer Agency个性化肿瘤基因组学(POG)研究产生的基因组与转录组测序数据

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基因组分类None
Genome and transcriptome sequence data from a primary unknown –looks like lung with nodes and pleural disease. prior breast cancer patient

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

原发灶不明疑似肺癌伴淋巴结及胸膜病变的乳腺癌既往患者基因组与转录组测序数据

该数据集是一份来自 ega-archive.org 的基因组与转录组测序数据,其英文名称为 “Genome and transcriptome sequence data from a primary unknown –looks like lung with nodes and pleural disease. prior breast cancer patient”。从名称可以看出,这份数据涉及一例原发灶不明、影像学表现类似肺部病变并伴有淋巴结与胸膜疾病的病例,且患者有乳腺癌既往史。该数据由 BC Cancer Agency 的个性化肿瘤基因组学(POG)研究产生,在本站归入肿瘤 / 乳腺癌分类。整体而言,这是一份面向肿瘤精准医学研究的测序数据资源,适合关注原发灶不明肿瘤、乳腺癌病史相关病例以及基因组与转录组联合分析的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集来源于 BC Cancer Agency 的个性化肿瘤基因组学(POG)研究。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,为肿瘤的分子特征刻画提供数据基础。本数据集对应的病例具有较为特殊的临床背景:原发灶不明,影像学表现类似肺部病变,并伴有淋巴结与胸膜疾病,同时患者有乳腺癌既往史。这一背景使该数据在肿瘤起源判定、转移灶鉴别以及既往肿瘤史相关分析等方向具有潜在的参考价值。本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类,反映了该病例与乳腺癌既往史的关联。

【数据内容】

该数据集包含基因组与转录组序列数据两类内容。基因组测序数据可用于分析肿瘤样本中的基因变异信息,转录组测序数据则可用于反映基因表达层面的特征。数据的具体样本数量、测序平台、测序深度、文件格式与数据规模等信息,源站未提供。主题标签信息源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ega-archive.org,即欧洲基因组-表型档案库(EGA),该平台用于存储和共享受控访问的基因组与表型数据。该数据集由 BC Cancer Agency 的个性化肿瘤基因组学(POG)研究产生。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集涉及的病例特征,其潜在适用场景包括:原发灶不明肿瘤的分子特征分析、肺部表现病变与乳腺癌既往史相关性的探索、基因组与转录组联合分析用于肿瘤分子分型研究,以及个性化肿瘤基因组学研究中方法学的参考与验证。由于该数据来自 POG 研究,也可作为精准肿瘤学背景下个案级测序数据的示例资源。具体适用场景的边界与限制,源站未提供。

【使用方法】

该数据集托管于 ega-archive.org,通常需遵循该平台的数据访问流程。关于本数据集的具体访问权限、申请条件、下载方式与分析工具建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单一个案相关的测序数据,其样本量、测序质量指标、数据完整性评估等信息源站未提供。使用时应结合源站的访问说明与数据描述进行判断。由于病例具有原发灶不明及既往乳腺癌史等复杂背景,数据解读需谨慎。其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议与使用条款,源站未提供。使用前应查阅 ega-archive.org 上的相关说明并遵循其数据使用政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015970

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Genome and transcriptome sequence data from a primary unknown –looks like lung with nodes and pleural disease. prior breast cancer patient [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015970

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