GDC CCDI-MCI:分子特征分析计划

该数据集来自 GDC 的 CCDI-MCI 项目,覆盖口腔及其他未特指部位、直肠乙状结肠交界、甲状腺、结缔组织及皮下软组织、周围神经和自主神经系统等原发部位,疾病类型包括囊性、黏液性和浆液性肿瘤、颗粒细胞瘤和腺泡状软组织肉瘤、特化性腺肿瘤、NOS 肿瘤、腺瘤和腺癌等

gdc
浏览 21
基因组分类Cystic, Mucinous and Serous NeoplasmsSpecialized Gonadal NeoplasmsNeoplasms, NOSAdenomas and AdenocarcinomasGliomasMeningiomasAcinar Cell NeoplasmsOdontogenic TumorsSoft Tissue Tumors and Sarcomas, NOSNevi and MelanomasMalignant Lymphomas, NOS or DiffuseEpithelial Neoplasms, NOS
GDC CCDI-MCI: Molecular Characterization Initiative (MCI)

基本信息

模态
基因组
大小
689406.497903932 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

GDC CCDI-MCI:分子特征分析计划

该数据集来自 GDC 的 CCDI-MCI 项目,覆盖口腔及其他未特指部位、直肠乙状结肠交界、甲状腺、结缔组织及皮下软组织、周围神经和自主神经系统等原发部位,疾病类型包括囊性、黏液性和浆液性肿瘤、颗粒细胞瘤和腺泡状软组织肉瘤、特化性腺肿瘤、NOS 肿瘤、腺瘤和腺癌等。数据集包含 3,076 例病例、51,298 个文件,总大小 642059.8 GB,提供临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据,分开放与受控访问层级,可用于肿瘤分子特征分析与分类研究(来源 portal.gdc.cancer.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):GDC 项目 CCDI-MCI(分子特征分析计划)。原发部位:口腔及其他未特指部位、直肠乙状结肠交界、甲状腺、结缔组织、皮下及其他软组织、周围神经和自主神经系统。疾病类型:囊性、黏液性和浆液性肿瘤,颗粒细胞瘤和腺泡状软组织肉瘤,特化性腺肿瘤,NOS 肿瘤,腺瘤和腺癌。计划:CCDI。病例数:3,076。文件数:51,298。总大小:642059.8 GB。NCI 基因组数据共享平台协调的癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。

【主题与分类】

主题标签:Cystic, Mucinous and Serous Neoplasms、Specialized Gonadal Neoplasms、Neoplasms, NOS、Adenomas and Adenocarcinomas、Gliomas、Meningiomas、Acinar Cell Neoplasms、Odontogenic Tumors、Soft Tissue Tumors and Sarcomas, NOS、Nevi and Melanomas。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/CCDI-MCI

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源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/CCDI-MCI

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 689406.50 GB。

数据说明

GDC项目CCDI-MCI(分子特征描述计划(MCI))。原发部位:口腔其他及未特指部位、直肠乙状结肠交界处、甲状腺、结缔组织、皮下组织及其他软组织、周围神经和自主神经系统。疾病类型:囊性、黏液性和浆液性肿瘤,颗粒细胞瘤和腺泡状软组织肉瘤,特化性腺肿瘤,肿瘤NOS,腺瘤和腺癌。项目:CCDI。病例数:3,076。文件数:51,298。总大小:642059.8 GB。NCI基因组数据共享平台协调化癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA测序、全外显子组测序、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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