乳腺癌细胞迁移中PFKL肝型功能需求数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.6m905qgfp

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 141.50 GB。

数据说明

有氧糖酵解增强和细胞运动性增加是转移性癌症的标志。迁移中的癌细胞高度极化，提示糖酵解酶可能受到空间调控。在此，我们研究了“守门”糖酵解酶磷酸果糖激酶-1的肝脏同工型（PFKL）在乳腺癌细胞迁移中的作用。敲低PFKL显著降低了迁移速度和方向感知能力。我们观察到PFKL定位于迁移中乳腺癌细胞的片状伪足，并与己糖激酶-2和丙酮酸激酶M2共定位。随后，我们研究了PFKL在定向迁移中的功能需求。首先，我们发现表达催化失活的PFKL或通过间接药理学抑制PFKL活性均显著降低了定向迁移。其次，我们发现通过表达丝状体形成缺陷型突变体来破坏PFKL丝状体形成，可减少PFKL向片状伪足的募集并降低方向感知能力，而不改变迁移速度。

这些发现表明，催化活性和亚细胞定位对于乳腺癌细胞的方向性迁移都是必需的。这些结果暗示了PFKL丝状结构在细胞中的新功能，并为理解细胞质中分区化糖酵解的功能提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。