北印度人群FGFR2基因变异与乳腺癌风险研究数据

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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.13f6n

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数据集大小约 503.2 KB。

数据说明

全基因组关联研究(GWAS)已确定成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)为乳腺癌的候选基因，其位于内含子2区域的单核苷酸多态性(SNPs)是与风险强烈相关的易感位点。然而，重复研究往往未能将这种关联外推到不同的种族区域。这提示不同人群之间存在异质性，这是由于基因组相关区域内SNPs的连锁不平衡(LD)结构和频率差异所致。因此，重要的是在不同人群群体中重新审视先前关联的候选基因，以揭示异质性的程度。为了探究FGFR2多态性在北印度女性乳腺癌风险易感性中的作用，我们通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)测定法对368名乳腺癌患者和484名健康对照者的rs2981582、rs1219648、rs2981578和rs7895676多态性进行了基因分型。我们观察到所有四种遗传变异均与乳腺癌风险存在统计学显著关联(P<0.05)。

在rs2981582、rs1219648、rs7895676的等位基因模型以及rs2981578的显性模型中，经Bonferroni校正后关联仍显著（P<0.0125）。进行分层分析后，观察到与多种临床病理特征以及环境和生活方式特征存在显著相关性。结果表明，rs1219648与外源性激素使用存在交互作用，rs2981578与晚期临床III期存在交互作用（经Bonferroni校正后，P<0.000694）。此外，对这4个位点的联合分析显示，与携带0–1个风险位点的女性相比，携带2–4个风险位点的女性风险增加（OR = 1.645，95%CI = 1.152–2.347，P = 0.006）。在单倍型分析中，对于rs2981578、rs2981582和rs1219648，风险单倍型（GTG）与显著的

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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