匹配的DCIS与浸润性导管乳腺癌FFPE组织中进展特异性基因数据集
该数据集来自figshare，包含一份XLS文件，基于WG-DASL分析比较了显微切割的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）乳腺组织样本中纯导管原位癌（DCIS）与浸润性导管癌（IBC）的基因表达差异，鉴定出1784个差异表达转录本（P<0.05）
基本信息
资源简介
匹配的DCIS与浸润性导管乳腺癌FFPE组织中进展特异性基因数据集
Additional file 1: of Progression-specific genes identified in microdissected formalin-fixed and paraffin-embedded tissue containing matched ductal carcinoma in situ and invasive ductal breast cancers
该数据集来自figshare，包含一份XLS文件，基于WG-DASL分析比较了显微切割的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）乳腺组织样本中纯导管原位癌（DCIS）与浸润性导管癌（IBC）的基因表达差异，鉴定出1784个差异表达转录本（P<0.05）。数据覆盖匹配的DCIS与IBC样本，可用于乳腺癌进展相关基因表达研究、差异表达分析及生物标志物探索（来源 figshare，CC BY + CC0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Progression-specific genes identified in microdissected formalin-fixed and paraffin-embedded tissue containing matched ductal carcinoma in situ and invasive ductal breast cancers》发表于 BMC Medical Genomics（2018），DOI：10.1186/s12920-018-0403-5。项目资助方：Deutsche Forschungsgemeinschaft。源站首次发布：2018-09-20。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：WG-DASL分析在FFPE乳腺癌组织样本中鉴定出1784个在DCIS与IBC之间差异表达的转录本（P<0.05）。（XLS 193 kb）
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 198.14 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.7116272.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Space Science、Medicine、Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：Breast cancer、Pure DCIS、Gene expression、Laser microdissection、Matched pairs、FFPE samples。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Space Science、Medicine、Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Progression-specific_genes_identified_in_microdissected_formalin-fixed_and_paraffin-embedded_tissue_containing_matched_ductal_carcinoma_in_situ_and_invasive_ductal_breast_cancers/7116272
使用许可：CC BY + CC0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Schultz, Silke; Bartsch, Harald; Sotlar, Karl; Petat-Dutter, Karina; Bonin, Michael; Kahlert, Steffen; et al. (2018). Additional file 1: of Progression-specific genes identified in microdissected formalin-fixed and paraffin-embedded tissue containing matched ductal carcinoma in situ and invasive duc…
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Additional file 1: of Progression-specific genes identified in microdissected formalin-fixed and paraffin-embedded tissue containing matched ductal carcinoma in situ and invasive ductal breast cancers
- DOI：10.6084/m9.figshare.7116272.v1
- 发布日期：2018-09-20
- 文件数：1 个
- 文件总体积：198.14 KB
- 源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Progression-specific_genes_identified_in_microdissected_formalin-fixed_and_paraffin-embedded_tissue_containing_matched_ductal_carcinoma_in_situ_and_invasive_ductal_breast_cancers/7116272
命令行下载
curl -L -o "12920_2018_403_MOESM1_ESM.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/13093733"
文件清单
12920_2018_403_MOESM1_ESM.xls（198.14 KB）
文件总体积 198.14 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
WG-DASL分析在FFPE乳腺癌组织样本中鉴定出1784个在DCIS与IBC之间差异表达的转录本（P < 0.05）。（XLS 193 kb）
许可
CC BY + CC0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.7116272.v1（source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Progression-specific_genes_identified_in_microdissected_formalin-fixed_and_paraffin-embedded_tissue_containing_matched_ductal_carcinoma_in_situ_and_invasive_ductal_breast_cancers/7116272）。
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