乳腺癌围手术期缺氧的前瞻性评估

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦女性乳腺癌患者围手术期缺氧的前瞻性评估。研究在患者麻醉后采集三份肿瘤样本:手术开始前(Sample A)、术中肿瘤约一半血供被阻断时的中期样本(Sample B)以及切除后的缺氧样本(Sample C)

Tata Memorial HospitalTata Memorial Hospital
clinicaltrials
浏览 17
基因组分类Breast Cancer Female
A Prospective Evaluation of the Peri-operative Hypoxia in Breast Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

乳腺癌围手术期缺氧的前瞻性评估

该数据集英文名为 A Prospective Evaluation of the Peri-operative Hypoxia in Breast Cancer,来源于 clinicaltrials.gov,本站分类为肿瘤 / 乳腺癌,主题标签为 Breast Cancer Female。数据集聚焦女性乳腺癌患者围手术期缺氧的前瞻性评估,研究对象为女性乳腺癌患者。研究在患者麻醉后采集三份肿瘤样本:手术开始前采集 Sample A;术中肿瘤约一半血供被阻断时采集中期样本 Sample B;切除后采集缺氧样本 Sample C。样本以 snap frozen、RNA later 和石蜡切片形式保存,用于未来基因组学和蛋白质组学评估,以理解乳腺癌手术期间急性缺氧所诱导的影响。

【数据集背景】

该数据集来自 clinicaltrials.gov,所属分类为肿瘤 / 乳腺癌,主题标签为 Breast Cancer Female。其研究背景聚焦于女性乳腺癌患者围手术期缺氧的前瞻性评估。源站描述显示,研究关注的是乳腺癌手术期间出现的急性缺氧所诱导的影响。为研究这一问题,需要在手术过程中获取临床样本(肿瘤活检),并保存这些样本以供未来基因组学和蛋白质组学评估。该数据集所对应的条件为 Breast Cancer Female,即女性乳腺癌患者。

【数据内容】

数据内容围绕女性乳腺癌患者手术过程中采集的肿瘤样本展开。根据源站描述,每位患者将获得三份肿瘤样本:第一份为手术开始前采集的 Sample A;第二份为术中中期样本,即当肿瘤约一半被去血管化时采集的 Sample B;第三份为切除后的缺氧样本 Sample C。这些肿瘤组织样本将以三种形式保存:snap frozen、RNA later 和石蜡切片。样本的用途是支持未来基因组学和蛋白质组学评估,以理解乳腺癌手术期间急性缺氧所诱导的影响。除上述样本类型、采集节点和保存形式外,源站未提供其他具体数据字段、变量或指标信息。

【采集与来源】

采集与来源方面,样本采集发生在患者处于麻醉状态之后。具体采集节点包括:手术开始前采集 Sample A;术中肿瘤约一半血供被阻断时采集中期样本 Sample B;切除后采集 Sample C。源站描述明确说明,这些肿瘤组织样本将作为 snap frozen、RNA later 和石蜡切片保存。数据来源站为 clinicaltrials.gov。除上述采集时机、样本数量和保存方式外,源站未提供采集地点、采集人员、样本量、时间跨度等更多来源信息。

【适用场景】

该数据集适用于围绕女性乳腺癌围手术期缺氧的前瞻性评估研究。其样本可用于未来基因组学和蛋白质组学评估,以理解乳腺癌手术期间急性缺氧所诱导的影响。由于样本覆盖手术开始前、术中肿瘤约一半血供被阻断时以及切除后三个节点,可用于比较不同手术阶段肿瘤组织在缺氧相关研究中的潜在差异。适用对象为女性乳腺癌患者相关研究。除上述方向外,源站未提供其他具体适用场景、分析目标或应用领域。

【使用方法】

源站描述指出,肿瘤组织样本将以 snap frozen、RNA later 和石蜡切片形式保存,用于未来基因组学和蛋白质组学评估。因此,使用方法应围绕这些保存形式所支持的后续实验展开。源站未提供具体的实验流程、数据处理步骤、分析工具、统计方法或操作指南。若需使用该数据集,应依据源站 clinicaltrials.gov 的原始记录获取进一步说明;除此之外,源站未提供更多使用方法信息。

【质量与限制】

源站未提供关于样本质量、数据完整性、偏倚控制、缺失值、质控指标或验证结果的信息。已知限制方面,源站描述仅说明样本采集节点、保存形式和未来评估方向,未提供样本量、随访信息、临床结局或数据可访问性说明。该数据集聚焦女性乳腺癌患者,未提及其他人群。由于源站未提供质量评估与限制说明,无法进一步判断其适用范围与局限性。

【引用与许可】

源站未提供引用方式、许可条款、数据使用协议或访问权限信息。该数据集来源站为 clinicaltrials.gov,如需引用或使用,应参考源站 clinicaltrials.gov 的相关规定。除来源站信息外,源站未提供其他引用与许可内容。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03797482

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:乳腺癌女性。患者处于麻醉状态后将获取三个肿瘤样本:1. 手术开始前(样本A)2. 术中中期样本,即在肿瘤一半血供被阻断时(即手术过程中的某个中间点)采集。(样本B)3. 第三个为切除后样本(缺氧样本C)。这些肿瘤组织样本将以速冻、RNA later保存及石蜡切片的形式储存。旨在了解乳腺癌手术过程中急性缺氧所诱导的影响。为研究此目的,将在术中获取临床样本(肿瘤活检),并储存以备未来的基因组学和蛋白质组学评估。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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