乳腺癌组织与循环中miR-205相关靶基因表达特征数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17632/x9f5m3t8cr

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数据集大小约 179.8 KB。

数据说明

该数据集是一项病例对照研究的组成部分，该研究旨在探讨乳腺癌中miR-205与所选靶基因之间的关系。核心假设是，miR-205（一种先前被认为与肿瘤抑制和上皮分化相关的microRNA）在乳腺癌中表达下调，而所选候选靶基因（NFIB、YAP1、ZEB1、RUNX2和AMOT）则呈现表达互反性升高。我们进一步假设，这些分子变化与疾病严重程度的临床病理特征相关，并可在组织和外周血两个组分中检测到。该数据集包括来自150名经组织学确诊的乳腺癌女性和150名在巴基斯坦拉合尔招募的健康女性对照的临床、病理及定量实时PCR（qRT-PCR）数据。乳腺癌患者提供了肿瘤组织、配对的癌旁非癌组织、外周血和血清样本，而对照者提供了外周血和血清样本。表达水平采用qRT-PCR进行定量，并以使用2^-ΔΔCt方法计算的相对表达值报告。

miR-205的表达以RNU6为内参进行标准化，而NFIB、YAP1、ZEB1、RUNX2和AMOT的mRNA表达以GAPDH为内参进行标准化。数据显示，与相应的对照样本相比，乳腺癌组织和血清中miR-205的表达显著降低。相反，乳腺癌组织和血液中NFIB、YAP1、ZEB1、RUNX2和AMOT的表达显著升高。多个生物标志物与肿瘤分期、分级、受体状态、分子亚型、肿瘤大小及转移状态相关。相关性分析显示，miR-205与多个靶基因之间存在负相关关系，尤其是在肿瘤组织内。探索性受试者工作特征分析提示miR-205及所选靶基因具有潜在的诊断价值，尽管这些发现需要独立的v

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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