胶质母细胞瘤患者肿瘤与配对对照脑组织的转录组分析
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，主题标签为 Transcriptomics。数据针对一名汉族胶质母细胞瘤患者，对其肿瘤组织与配对正常脑组织进行全转录组分析，以研究差异基因表达
基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤患者肿瘤与配对对照脑组织的转录组分析
该数据集名为“Transcriptomic profiling of a glioblastoma multiforme patient with matched control brain tissue”，来源于 omicsdi.org，归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，主题标签为 Transcriptomics。数据集针对一名汉族胶质母细胞瘤患者，采集其肿瘤组织与配对的正常脑组织，开展全转录组分析，以研究两者之间的差异基因表达。研究使用 Illumina GA2 平台对 mRNA 进行提取和测序，并采用 RNASEQR、ERANGE、MapSplice、SpliceMap 和 TopHat 等程序对原始数据进行分析。整体而言，该数据集提供了同一患者肿瘤与对照脑组织的转录组测序信息，可用于观察胶质母细胞瘤相关的基因表达变化。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是中枢神经系统中常见的恶性肿瘤，其分子特征复杂。为探究该肿瘤在转录水平上的异常，该数据集围绕一名汉族胶质母细胞瘤患者展开，将肿瘤组织与配对的正常脑组织进行对比。这种同一患者来源的配对设计有助于减少个体间遗传背景差异带来的干扰，使差异基因表达分析更聚焦于肿瘤与正常组织之间的区别。数据集所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为 Transcriptomics，表明其核心内容是全转录组层面的表达信息。
【数据内容】
该数据集包含来自一名汉族胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和配对正常脑组织的全转录组数据。研究对上述组织的 mRNA 进行了提取和测序，目标是分析肿瘤与匹配正常脑组织之间的差异基因表达。数据涉及转录组测序产生的原始数据，并经过多个分析程序处理。除原始测序数据外，源站描述还提及使用 RNASEQR、ERANGE、MapSplice、SpliceMap 和 TopHat 等程序对原始数据进行分析。关于数据的具体样本数量、测序深度、基因数量、表达值矩阵或差异基因列表等细节，源站未提供。
【采集与来源】
样本来自一名汉族胶质母细胞瘤患者，包括肿瘤组织和配对的正常脑组织。mRNA 的提取和测序在 Illumina GA2 平台上完成。原始数据随后使用 RNASEQR、ERANGE、MapSplice、SpliceMap 和 TopHat 等程序进行分析。数据集来源站为 omicsdi.org。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、患者年龄、性别、治疗背景等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关研究，尤其是胶质母细胞瘤与正常脑组织之间差异基因表达的比较分析。由于采用了同一患者的肿瘤与配对正常组织，该数据可用于探索肿瘤特异性的表达改变，也可作为脑肿瘤转录组分析流程的参考数据。此外，数据中涉及多种分析程序，可能对 RNA-seq 数据处理、剪接分析或表达定量方法的比较研究具有参考价值。关于该数据集是否适用于其他肿瘤类型、其他人群或临床诊断场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取。源站描述表明，原始数据经过 RNASEQR、ERANGE、MapSplice、SpliceMap 和 TopHat 等程序分析。使用者在获取数据后，可根据自身研究目的进行差异表达分析、转录本组装或剪接事件检测等。关于具体的下载方式、文件格式、数据访问权限、是否需要注册或申请、以及各分析程序的具体参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于一名汉族胶质母细胞瘤患者的肿瘤与配对正常脑组织，样本量有限，因此其结论在推广到更广泛人群或其他胶质母细胞瘤亚型时需谨慎。数据使用 Illumina GA2 平台产生，并采用多种程序进行分析，但源站未提供测序质量指标、覆盖度、重复性、批次效应或验证实验等信息。关于数据是否存在技术偏差、生物学重复情况、以及分析结果的可靠性评估，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、作者列表、许可协议或使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33328
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了探究差异基因表达，我们分析了取自一位多形性胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织及其匹配的正常脑组织的全部转录组。我们使用Illumina GA2平台提取并测序了mRNA。原始数据通过我们最近开发的名为RNASEQR的程序，以及ERANGE、MapSplice、SpliceMap和TopHat进行分析。肿瘤和匹配的对照脑组织来自一位汉族中国患者。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
