临床试验中接受放疗或放疗联合temozolomide治疗的同质胶质母细胞瘤患者样本转录组分析
该数据集来自omicsdi.org，收录了80例在临床试验中接受治疗的胶质母细胞瘤患者样本以及4例非肿瘤正常脑组织的转录组分析数据
基本信息
资源简介
临床试验中接受放疗或放疗联合temozolomide治疗的同质胶质母细胞瘤患者样本转录组分析
该数据集聚焦于胶质母细胞瘤在标准放化疗方案下的转录组特征，来源于omicsdi.org，归类于肿瘤/脑肿瘤方向。数据集全称为“Transcription profiling of human glioblastoma samples from a homogenous cohort of patients treated within clinical trial with eitehr radiotherapy or radiotherapy and temonzolomide”，其核心内容是对80例在临床试验中接受放疗或放疗联合替莫唑胺治疗的胶质母细胞瘤患者样本，以及4例非肿瘤正常脑组织样本进行转录组分析。该数据集的主题标签为Transcriptomics，旨在通过基因表达层面的数据，帮助研究者理解胶质母细胞瘤对放化疗联合方案的抵抗机制，并为后续转化研究提供基础资源。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是中枢神经系统最具侵袭性的肿瘤之一，临床治疗常采用放疗联合烷化剂替莫唑胺的化疗方案。然而，患者对该方案的抵抗现象较为常见，其分子机制尚未完全阐明。该数据集正是围绕这一临床问题而构建，来源于一项临床试验中接受放疗或放疗联合替莫唑胺治疗的患者队列。通过比较肿瘤样本与非肿瘤正常脑组织的转录组，研究者可以探索与治疗抵抗相关的基因表达特征。数据集的英文名称明确指出了其研究背景：来自同质患者队列的胶质母细胞瘤样本的转录谱分析，这些患者均在接受放疗或放疗联合替莫唑胺的临床试验中接受治疗。
【数据内容】
该数据集包含80例胶质母细胞瘤标本和4例非肿瘤正常脑组织样本。所有样本均进行了转录组分析，主题标签为Transcriptomics。源站描述指出，该数据用于识别对放疗联合替莫唑胺（烷化剂）同步及辅助化疗方案的抵抗因素。实验总体设计为80例胶质母细胞瘤标本和4例非肿瘤脑样本。数据集本身不包含临床结局、生存信息或具体基因列表等额外内容，这些信息在现有描述中未予提供。
【采集与来源】
数据集来源于omicsdi.org，该平台为组学数据资源的聚合站点。原始样本来自在临床试验中接受治疗的患者，具体临床试验的注册信息、伦理审批细节、样本采集时间点、患者纳入排除标准等，源站未提供。样本类型包括胶质母细胞瘤标本和非肿瘤正常脑组织，后者作为对照。数据生成的具体技术平台、测序深度、文库构建方法等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胶质母细胞瘤转录组层面的探索性研究，例如识别与放化疗抵抗相关的差异表达基因、通路富集分析、肿瘤与正常脑组织的表达谱比较，以及作为更大规模meta分析的组成部分。由于样本来自同质临床试验队列，该数据可用于研究特定治疗方案下的分子特征，但不适用于直接推断其他治疗方案的疗效或抵抗机制。此外，该数据集也可用于方法学验证，如批次效应评估、归一化策略比较等，但需注意样本量有限。
【使用方法】
使用者可通过omicsdi.org获取该数据集，具体下载方式、文件格式、数据访问权限等，源站未提供。在分析时，建议将80例肿瘤样本与4例正常脑组织样本进行分组比较，并考虑临床试验治疗背景对表达谱的潜在影响。由于缺乏临床注释，无法进行生存分析或治疗反应关联分析。使用前应确认数据版本和预处理状态，源站未提供相关说明。
【质量与限制】
该数据集的主要限制包括：样本量相对有限，尤其是正常脑组织仅4例，可能影响统计效力；缺乏临床结局、治疗反应、生存时间等关键注释信息；源站未提供数据生成的技术细节、质量控制指标、批次信息等。此外，数据集名称中存在拼写错误（“eitehr”应为“either”，“temonzolomide”应为“temozolomide”），但不影响数据内容本身。由于信息有限，无法评估样本异质性、RNA质量或测序质量。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用限制等，源站未提供。使用者应遵循omicsdi.org及原始数据提供方的相关条款。建议在发表成果时引用原始数据集来源，并注明数据获取途径。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-7696
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
分析80例在临床试验中接受治疗的患者胶质母细胞瘤标本及4例“正常”脑组织（非肿瘤）样本。该数据用于识别对放疗联合同步及辅助替莫唑胺（烷化剂）化放疗方案耐药的因子。实验总体设计：80例胶质母细胞瘤标本和4例非肿瘤脑样本
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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