85例来自74位患者的人类胶质瘤转录谱分析：阐明胶质瘤生物学、预测生存并定义肿瘤亚类
该数据集来自 omicsdi.org，收录了 85 例来自 74 位患者的人类胶质瘤转录谱数据，属于肿瘤/脑肿瘤范畴。研究通过转录谱分析阐明胶质瘤生物学、预测生存并定义肿瘤亚类，发现转录谱在预测生存方面比传统病理分级更准确，且胶质瘤特征性表达四类分子特征之一：神经发生、突触传递、有丝分裂或细胞外基质
基本信息
资源简介
85例来自74位患者的人类胶质瘤转录谱分析：阐明胶质瘤生物学、预测生存并定义肿瘤亚类
该数据集聚焦于人类胶质瘤的转录谱分析，收录了来自74位患者的85例胶质瘤样本，属于肿瘤与脑肿瘤研究范畴，主题标签为转录组学。研究目的在于通过转录谱数据阐明胶质瘤的生物学特性、预测患者生存情况，并定义肿瘤的分子亚类。源站描述指出，弥漫性浸润性胶质瘤是成人中最常见的原发性脑恶性肿瘤，而多形性胶质母细胞瘤作为最高级别的胶质瘤，其中位生存期仅为7个月。该数据集通过大规模转录谱分析，试图揭示与生存相关的分子特征，为胶质瘤的预后判断和靶向治疗提供依据。整体而言，该数据集是胶质瘤转录组学研究的重要资源，强调转录谱在生存预测方面可能优于传统病理分级。
【数据集背景】
弥漫性浸润性胶质瘤是成人中最常见的原发性脑恶性肿瘤，其中多形性胶质母细胞瘤为最高级别胶质瘤，与中位生存期7个月相关。传统的病理分级在预测患者生存方面存在局限，因此需要更精确的分子层面工具来阐明胶质瘤生物学、预测生存并定义肿瘤亚类。该数据集正是在这一背景下产生，旨在通过转录谱分析探索胶质瘤的分子特征，并评估其在生存预测中的价值。源站描述强调，转录谱分析能够比传统病理分级更准确地预测生存，这为胶质瘤的临床管理提供了新的视角。
【数据内容】
该数据集包含85例人类胶质瘤的转录谱数据，这些样本来自74位患者。研究通过转录谱分析，揭示了胶质瘤特征性表达四类协同调控的基因分子特征之一：神经发生、突触传递、有丝分裂或细胞外基质。这些分子特征与生存相关，有助于肿瘤预后判断，并可能定义未来定向治疗的靶点。数据集的主题标签为转录组学，表明其核心数据类型为基因表达谱。源站描述还提到，研究评估了大量弥漫性浸润性胶质瘤的转录谱，但具体评估方法和样本细节未在现有信息中展开。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org，分类为肿瘤/脑肿瘤。源站描述提供了研究的基本背景和目的，但未详细说明样本采集的具体地点、时间范围、伦理审批信息或测序平台。关于数据采集的具体流程、样本处理方式以及原始数据生成的技术手段，源站未提供。因此，无法确定样本是否来自特定医院或研究机构，也无法得知转录谱分析所使用的具体技术（如微阵列或RNA测序）。数据来源站为omicsdi.org，该平台可能整合了多个组学数据集，但本数据集的原始贡献者信息未在现有资料中体现。
【适用场景】
该数据集适用于胶质瘤的转录组学研究，特别是探索生存相关分子特征和肿瘤亚类定义。潜在应用包括：验证转录谱在预测胶质瘤患者生存方面是否优于传统病理分级；识别神经发生、突触传递、有丝分裂或细胞外基质等分子特征与临床结局的关联；为胶质瘤的分子分型提供参考；以及辅助发现新的治疗靶点。此外，该数据集可用于比较不同级别胶质瘤的转录谱差异，或作为meta分析的组成部分。由于数据涉及74位患者的85例样本，适合进行生存分析、聚类分析和分子特征验证等生物信息学任务。
【使用方法】
关于该数据集的具体使用方法，源站未提供。通常，转录谱数据可通过omicsdi.org平台获取，用户可能需要下载表达矩阵或原始数据文件，并利用生物信息学工具进行预处理、归一化和差异表达分析。然而，针对本数据集的具体访问方式、文件格式、数据预处理步骤或推荐分析流程，现有信息中未给出说明。因此，无法提供详细的操作指南。用户应参考源站omicsdi.org上的相关说明或联系数据提供者以获取使用指导。
【质量与限制】
该数据集的质量与限制信息在现有资料中未充分说明。源站描述提到转录谱分析在预测生存方面比传统病理分级更准确，但未提供具体的准确性指标、验证方法或统计效力。样本量为85例胶质瘤来自74位患者，可能存在样本异质性或重复采样问题，但具体细节未提及。此外，数据是否经过标准化处理、是否存在批次效应、以及是否包含临床注释信息（如生存时间、病理分级等），源站均未提供。因此，用户在使用时需谨慎评估数据质量，并注意缺乏详细元数据可能带来的分析限制。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式和许可信息，源站未提供。用户在使用或发表相关研究时，应参考omicsdi.org平台上的通用引用指南，或直接联系数据贡献者以获取具体的引用要求。由于缺乏明确的许可声明，无法确定数据是否可以自由使用、修改或再分发。建议用户在使用前仔细阅读源站的相关条款，并遵守学术规范进行适当引用。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-4412
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
弥漫性浸润性胶质瘤是成人中最常见的原发性脑恶性肿瘤，而多形性胶质母细胞瘤作为最高级别的胶质瘤，其中位生存期仅为7个月。通过对来自74名患者的85例胶质瘤进行转录谱分析，旨在阐明胶质瘤生物学特性、预测生存期并定义肿瘤亚类。这些研究表明，胶质瘤的转录谱分析在预测生存期方面比传统病理分级更为准确，并且胶质瘤特征性地表达四种分子特征之一中的协同调控基因：神经发生、突触传递、有丝分裂或细胞外基质。阐明这些与生存相关的分子特征将有助于肿瘤预后判断，并为未来的靶向治疗确定靶点。通过转录谱分析评估大量弥漫性浸润性胶质瘤。通过大规模基因表达研究，可能识别出胶质瘤肿瘤亚类。
1996年至2003年间，在加利福尼亚大学洛杉矶分校接受原发性脑癌手术治疗的所有患者均被邀请参与这项经机构审查委员会批准的研究。参与该广泛研究方案的74名患者中，若其初次手术治疗时诊断为任何组织学类型的III级（n=24）或IV级（n=50）胶质瘤，并获取了新鲜冷冻材料，则纳入本研究的分析。本研究仅纳入III级和IV级胶质瘤，因为这两级之间的区分较为微妙，容易发生误分类。对所有研究样本，记录了从切除到死亡之日的时间（以天计），若患者仍存活，则记录至当前日期。患者确诊时的年龄从18岁到82岁不等。其中女性46名，男性28名。使用标准的Affymetrix方案制备探针，并与Affymetrix HG-U133A和HG-U133B阵列进行杂交。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
