胶质瘤细胞群对辐照的时间响应:剂量与细胞密度效应建模

该数据集来自 search.dataone.org,包含 F98 胶质瘤细胞在不同辐射剂量和初始细胞密度下的延时荧光显微成像实验,用于追踪细胞密度变化

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医学影像预测Radiation effectsMathematical modelsmathematical modellingtime-lapse microscopycancerirradiationRadiobiology
The temporal response of a glioma cell population to irradiation: modeling the effect of dose and cell density

基本信息

模态
医学影像
任务类型
预测
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

胶质瘤细胞群对辐照的时间响应:剂量与细胞密度效应建模

The temporal response of a glioma cell population to irradiation: modeling the effect of dose and cell density

该数据集来自 search.dataone.org,包含 F98 胶质瘤细胞在不同辐射剂量和初始细胞密度下的延时荧光显微成像实验,用于追踪细胞密度变化。基于这些结果建立了描述癌细胞群对单剂量放疗时间响应的区室模型,该模型仅用三个自由参数(另四个固定参数)即可很好地重现全部实验数据,可追踪辐照后衰老细胞和修复细胞等不同细胞群的演化,估计存活分数,并分析死亡与衰老细胞群对修复细胞再生的抑制效应(队列效应)。数据可用于放射生物学建模与细胞群动态预测研究(来源 DataONE,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):通过延时荧光显微成像实验追踪 F98 胶质瘤细胞在不同辐射剂量和初始细胞密度下的细胞密度。基于这些结果,建立了一个描述癌细胞群对单剂量放射治疗时间响应的区室模型。该模型仅用三个自由参数(另四个固定参数)即可很好地重现全部实验数据。它允许获取并追踪辐照后不同细胞群的演化,特别是衰老细胞群和修复细胞群。从这些不同细胞群中,还可以估计存活分数。最重要的是,我们的模型允许分析和量化死亡细胞群和衰老细胞群对修复细胞群再生的抑制效应(或队列效应)。, , , The temporal respon

【主题与分类】

主题标签:Radiation effects、Mathematical models、mathematical modelling、time-lapse microscopy、cancer、irradiation、Radiobiology。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae0f4387ef304aa3a29181da8501a5ec282e648ea8e816c092e4345dd7356b1e1

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

进行了延时荧光显微镜实验,以追踪在不同辐射剂量和初始细胞密度下F98胶质瘤细胞的细胞密度。基于这些结果,构建了一个描述癌细胞群体对单剂量放射治疗时间响应的分区模型。该模型仅用三个自由参数(另有四个固定参数)就能很好地重现所有实验数据。它允许获取并跟踪照射后不同细胞群体的变化,特别是衰老和修复细胞群体。基于这些不同的细胞群体,还可以估算存活分数。

最重要的是,我们的模型能够分析和量化死亡细胞群体和衰老细胞群体对修复后细胞群体再生的抑制作用(或队列效应)。,,,,# 胶质瘤细胞群体对照射的时间响应:建模剂量和细胞密度的影响 https://doi.org/10.5061/dryad.qv9s4mwp5 ## 数据和文件结构描述 这些数据是每个时间点(每90分钟)的归一化细胞密度和标准差,初始细胞密度从孔1到孔6递增(如手稿中所述)。剂量在文件名开头标明:0GY、5 Gy、10 Gy和15 Gy。 ### 文件和变量 #### 文件:averaged_curves_article.zip **描述:**对应于不同照射剂量(0、5、10和15 Gy)和不同初始细胞密度(从孔1到孔6递增)的文件列表。 ## 代码/软件 这些文件是文本文件,可以用任何文本编辑器打开。包含两个代码,一个(Modele_Control.py)用于在对照情况(0Gy)下用我们的模型拟合数据,第二个(Mod…

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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