儿童、青少年及年轻成人脑肿瘤患者脑脊液游离肿瘤DNA检测

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05934630

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：间变性星形细胞瘤、弥漫性脑干胶质瘤、多形性胶质母细胞瘤、高级别星形细胞瘤 NOS、纤维型星形细胞瘤、低级别星形细胞瘤 NOS、毛细胞型星形细胞瘤、脉络丛癌。这是一项针对患有原发性脑肿瘤的儿童和青年人的多中心研究。所有年龄 ≤21 岁的儿童和青少年/青年（AYA）患者均符合入选条件。患有在儿童中比成人更常见的原发性脑肿瘤类型且年龄 < 40 岁的 AYA 患者符合入选条件。最多 300 人将参加这项研究。儿童中枢神经系统（CNS）肿瘤涵盖多种疾病，并且仍然是儿童和青少年癌症相关死亡的主要原因。过去几年，儿童 CNS 肿瘤的诊断和病理分类发生了巨大转变。分子生物标志物目前正被纳入治疗决策和临床试验设计。因此，对疾病进行纵向分子监测的需求日益明显。获取儿童 CNS 恶性肿瘤时的解剖学挑战，加之向分子亚分类和分子靶向治疗的转变，导致迫切需要开发一种非侵入性方法来反复对这些肿瘤取样。这将使得以下成为可能：1）诊断手术无法到达的肿瘤；2）纵向监测肿瘤的分子变化，包括在进展和/或复发时；3）开发监测治疗反应的非侵入性方法。最近的技术进展已使得能够检测游离肿瘤 DNA（cfDNA），即肿瘤 DNA 的小片段；在脑肿瘤患者中，这些片段通过一种称为“液体活检”的过程释放到脑脊液（CSF）和血液中。基于在成人胶质瘤患者中成功的初步研究，这项由儿童脑肿瘤联盟（PBTC）资助的工作将尝试将 CSF cfDNA 液体活检整合到 PBTC 各机构的儿童脑肿瘤患者临床诊疗中，以提高肿瘤诊断/分子亚分类水平并指导治疗决策。这将通过集中收集和处理……来实现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。