胃肠道间质瘤手术：治疗、肿瘤建模与基因组分析

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04557969

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：胃癌、胃肿瘤、胃肠道间质肉瘤、胃肠道间质肿瘤、胃肠道间质瘤（GIST）。背景：胃肠道间质瘤（GISTs）是最常见的胃肠道软组织肉瘤，但仍属于罕见病范畴。大多数GIST以KIT或PDGFRA突变为特征，使其对酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗敏感。野生型（WT）GIST较为罕见，通常以SDH突变和/或缺乏KIT或PDGFRA突变为特征；副神经节瘤常与WT GIST相关。非WT GIST可能对TKI治疗产生耐药，而WT GIST通常对TKI治疗具有抵抗性。GIST的主要治疗方式是手术切除，可能涉及胃、肝脏和/或腹膜表面；大多数患者将需要多次手术以移除对系统性药物无反应的病灶。研究性系统性疗法受限于毒性作用和/或疗效不足，导致对新治疗选择的需求尚未得到满足。

获取新鲜肿瘤组织对于成功开发用于药物研究的GIST模型至关重要，对于下一代肿瘤基因组测序也同样重要，并有助于识别用于治疗WT和TKI耐药的非WT GIST的新靶点和/或药物。目的：评估和随访GIST患者，尤其是WT和治疗难治性非WT患者，以支持针对这一罕见疾病的转化研究。评估手术切除后的无病间期（DFIs），至少5年。入选标准：经组织学确诊或临床表现疑似GIST的患者。设计：前瞻性队列研究。经组织学确诊或临床表现疑似GIST的患者将入组研究，并在手术切除和/或减瘤术前长达10年及术后长达5年内，每9-15个月进行一次主动监测。由于参与者在研究过程中可能接受多次切除，术后5年监测可相对于最后一次切除多次启动。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。