通过MR波谱纵向观测2-羟基戊二酸研究IDH突变胶质瘤生物学

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03952598

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数据说明

疾病：胶质瘤、胶质瘤病、高级别胶质瘤、恶性胶质瘤、低级别胶质瘤。背景：* 胶质瘤是最常见的恶性脑肿瘤。编码异柠檬酸脱氢酶（IDH）这一代谢酶的基因在胶质瘤中频繁突变，尤其是在低级别胶质瘤（LGGs）中。IDH突变导致独特的肿瘤生物学特性，包括致癌代谢物2-羟基戊二酸（2-HG）的积累，进而引起基因组高度甲基化和肿瘤发生。* 尽管与IDH野生型相比，IDH突变型LGGs预后较好，但它们会经历缓慢但持续的高级别转化（HT），最终成为高级别胶质瘤（HGGs）。一部分转化后的HGGs患者会出现超突变表型（HMP），这可能与先前使用烷化剂治疗有关。HT和HMP的发展时间线不可预测，目前尚无已知方法预防其发生，这很大程度上是因为对其生物学机制理解不足，以及缺乏潜在早期检测的非侵入性方法。

• 代谢成像，包括质子磁共振波谱（MRS）和超极化（HP）13C-丙酮酸MRSI，可安全检测人体内的代谢变化。* 这项临床研究将允许对IDH突变型胶质瘤参与者进行纵向监测，以检测与代谢改变相关的疾病进展，为肿瘤活检提供前所未有的机会，以进行诊断确认和探究HT和HMP机制，并可能为传统脑肿瘤治疗难以治愈的HMP提供一种特异性治疗方法。目的：通过质子MRS和HP 13C丙酮酸MRSI分别纵向检测和监测IDH突变型胶质瘤参与者中2-HG和乳酸/丙酮酸比值的定量水平。入选标准：* 参与者患有经DNA测序确认的携带IDH1或IDH2突变的胶质瘤。* 年龄≥18岁，KPS≥70%。设计：* 这是一项前瞻性观察

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。