少突胶质细胞瘤单细胞RNA-seq分析

Bridge of Knowledge 是一个门户网站,您可以在其中展示您的科学成就。主题标签:肿瘤、脑肿瘤、少突胶质细胞瘤、单细胞RNA-seq、转录组分析

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基因组分类肿瘤脑肿瘤少突胶质细胞瘤单细胞RNA-seq转录组分析
Single cell RNA-seq analysis of oligodendroglioma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

少突胶质细胞瘤单细胞RNA-seq分析

Single cell RNA-seq analysis of oligodendroglioma 是一个以少突胶质细胞瘤为研究对象的单细胞 RNA 测序分析数据集,在站内归入肿瘤 / 脑肿瘤分类。该数据集来源于 mostwiedzy.pl,该站被描述为“Bridge of Knowledge”门户,用于展示科研成就。围绕这一数据集的主题标签包括肿瘤、脑肿瘤、少突胶质细胞瘤、单细胞 RNA-seq 与转录组分析,反映出其聚焦于脑肿瘤中少突胶质细胞瘤在单细胞层面的转录组研究。整体而言,该数据集面向对少突胶质细胞瘤分子特征与细胞异质性感兴趣的研究人员,提供与单细胞转录组分析相关的数据资源,其具体样本规模、测序平台与分析流程等细节需以源站发布的信息为准。

【数据集背景】

少突胶质细胞瘤是脑肿瘤中的一种类型,属于肿瘤研究的重要对象。该数据集以 Single cell RNA-seq analysis of oligodendroglioma 为英文名称,定位于肿瘤 / 脑肿瘤方向,围绕少突胶质细胞瘤开展单细胞 RNA 测序分析。数据集来源于 mostwiedzy.pl,该来源站被描述为“Bridge of Knowledge”门户,其用途是让科研人员展示自身的科学成就。因此,该数据集可视为依托该门户公开呈现的一项科研数据资源,主题覆盖肿瘤、脑肿瘤、少突胶质细胞瘤、单细胞 RNA-seq 与转录组分析等方向。关于该数据集所依托的具体研究项目背景、立项机构与资助信息,源站未提供。

【数据内容】

从主题标签来看,该数据集的内容涉及少突胶质细胞瘤的单细胞 RNA 测序与转录组分析,属于在单个细胞层面解析肿瘤转录组特征的数据类型。其英文名称明确指向“单细胞 RNA-seq 分析”,说明数据内容围绕单细胞转录组展开。关于数据的具体组成,例如样本数量、细胞数目、基因表达矩阵的维度、是否包含配套的细胞注释或临床信息等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 mostwiedzy.pl。该来源站被描述为“Bridge of Knowledge”门户,用于展示科学成就。数据集通过该门户对外呈现,属于该平台上的科研数据资源之一。关于样本采集的具体方式、测序平台、建库策略、数据处理流程等采集与生产细节,源站未提供。

【适用场景】

依据其主题标签,该数据集适用于少突胶质细胞瘤相关的单细胞转录组研究场景,例如在单细胞层面考察脑肿瘤的转录组特征。由于主题同时涵盖肿瘤与脑肿瘤,也可用于脑肿瘤方向的比较性或探索性分析。关于更具体的适用场景,如特定分析任务、模型训练或临床转化用途,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、文件格式、访问接口与配套分析工具等信息。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、批次效应控制与使用限制等方面的说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://mostwiedzy.pl/en/open-research-data/oligodendroglioma-nos-male-45-tissue-image-5270730023449221,5270730023449221-4

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gdański Uniwersytet Medyczny (2022). Oligodendroglioma, NOS - Male, 45 - Tissue image [5270730023449221] [Dataset]. http://doi.org/10.34808/pz35-4289

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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