跨年龄与部位的H3-K27M突变弥漫性中线胶质瘤单细胞多组学研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001006994

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

组蛋白3第27位赖氨酸到甲硫氨酸（H3-K27M）突变最常发生于儿童脑桥弥漫性中线胶质瘤（DMGs），但在成人DMGs中也日益被认识。其在不同年龄和解剖中线位置的潜在异质性研究极为不足。本研究通过剖析一个全面的H3-K27M DMG患者队列的单细胞转录组、表观基因组和空间结构，我们揭示了在共享驱动突变背景下，年龄和解剖位置如何塑造胶质瘤细胞内在和外在特征。我们对50例H3-K27M突变患者肿瘤进行了多组学分析。我们对43例肿瘤进行了深度全长Smart-seq2新鲜单细胞（n=18）或冷冻单核（n=25）RNA测序（sc/snRNA-seq）。此外，我们利用单细胞/核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq）分析了8例肿瘤的开放染色质图谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。