序列上下文特异性DNA去甲基化塑造IDH突变少突胶质瘤与星形细胞瘤的进展
主题标签：肿瘤、脑肿瘤、IDH突变、少突胶质瘤、星形细胞瘤、DNA去甲基化、序列上下文。本数据集为肿瘤领域公开数据集，主题涵盖肿瘤。
基本信息
资源简介
序列上下文特异性DNA去甲基化塑造IDH突变少突胶质瘤与星形细胞瘤的进展
该数据集英文名为 Sequence context specific DNA de-methylation shapes progression of IDH mutant oligodendrogliomas and astrocytomas，归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，来源于 ebi.ac.uk。从名称与主题标签看，该数据集围绕肿瘤尤其是脑肿瘤展开，聚焦 IDH 突变背景下的少突胶质瘤与星形细胞瘤，涉及 DNA 去甲基化与序列上下文等主题。作为肿瘤领域的公开数据集，它为相关研究提供了可访问的数据资源，主题涵盖肿瘤，并具体指向 IDH 突变型胶质瘤的进展机制研究。以下依据可获得的信息，从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
该数据集的主题集中于肿瘤、脑肿瘤，具体涉及 IDH 突变、少突胶质瘤、星形细胞瘤、DNA 去甲基化与序列上下文等关键词。从标题可以看出，其研究关注序列上下文特异性的 DNA 去甲基化如何塑造 IDH 突变型少突胶质瘤与星形细胞瘤的进展。IDH 突变型胶质瘤是脑肿瘤研究中的重要对象，而 DNA 去甲基化与序列上下文的关系则是理解这类肿瘤进展机制的一个切入点。该数据集作为肿瘤领域的公开数据集，主题涵盖肿瘤，为探索上述生物学问题提供了数据基础。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括肿瘤、脑肿瘤、IDH 突变、少突胶质瘤、星形细胞瘤、DNA 去甲基化、序列上下文。由此可知，数据内容围绕 IDH 突变型少突胶质瘤与星形细胞瘤中的 DNA 去甲基化现象及其序列上下文特征展开。关于数据的具体类型、样本数量、文件格式、字段结构、测序平台或实验设计等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，源站描述中标注了作者 Adela Brzobohata 及数据集标题，并给出了访问地址 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD070222。该地址指向 PRIDE 归档项目 PXD070222。关于样本采集地点、采集时间、实验流程、仪器型号等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于肿瘤尤其是脑肿瘤相关研究，特别是围绕 IDH 突变型少突胶质瘤与星形细胞瘤的进展机制、DNA 去甲基化及其序列上下文特异性的分析。它可用于探索去甲基化事件与序列上下文之间的关系，或作为相关主题研究的公开数据资源。关于更具体的适用分析类型或建模场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过源站给出的地址 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD070222 访问。关于数据下载方式、文件组织、预处理步骤、分析工具或使用协议等具体使用方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为公开数据集，来源站为 ebi.ac.uk。关于数据质量评估指标、完整性、批次效应、样本量、技术偏差或已知局限性等信息，源站未提供。使用时应结合源站项目页面所附信息进行判断。
【引用与许可】
源站描述中给出的引用信息为：Adela Brzobohata, Sequence context specific DNA de-methylation shapes progression of IDH mutant oligodendrogliomas and astrocytomas [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD070222。关于该数据集的许可条款、使用限制或再分发条件，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD070222
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Adela Brzobohata, Sequence context specific DNA de-methylation shapes progression of IDH mutant oligodendrogliomas and astrocytomas [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD070222
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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