铜-苯并咪唑配合物C1和C2处理LN229胶质瘤细胞的RT-PCR基因表达数据
该数据集包含从LN229人胶质瘤细胞中获得的定量实时PCR(qRT-PCR)基因表达数据,这些细胞用两种铜-苯并咪唑配合物C1和C2处理48小时,浓度分别对应其IC50值(8.23 µM和5.93 µM)

基本信息
资源简介
铜-苯并咪唑配合物C1和C2处理LN229胶质瘤细胞的RT-PCR基因表达数据
该数据集为 RT-PCR 基因表达数据,来源于用铜-苯并咪唑配合物 C1 和 C2 处理后的 LN229 人胶质瘤细胞。处理时间为 48 小时,两种配合物的使用浓度分别对应其 IC50 值,即 8.23 µM 和 5.93 µM。数据涵盖 raw Ct 值以及经过处理的相对表达数据,涉及 DNA 损伤应答基因 ATM、ATR,抗氧化防御基因 CAT、SOD2、GPX1,以及细胞周期调控基因 CDKN1A;RNA18SN5 与 ACTB 作为参考基因。相对基因表达采用 ΔΔCt 法计算,并以 RQ = 2^−ΔΔCt 表示。数据集英文名称为 RT-PCR gene expression data for LN229 glioma cells treated with copper-benzimidazole complexes C1 and C2,本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤,来源站为 doi.org,作者为 Korga-Plewko, Agnieszka,机构为 RepOD,发布时间为 2026 年。
【数据集背景】
该数据集面向肿瘤尤其是脑肿瘤研究场景,聚焦 LN229 人胶质瘤细胞在铜-苯并咪唑配合物干预下的基因表达响应。实验使用两种配合物 C1 和 C2,处理时间统一为 48 小时,浓度分别取其 IC50 值 8.23 µM 与 5.93 µM,从而在接近半数抑制的暴露水平下观察转录层面的变化。所关注的基因覆盖 DNA 损伤应答、抗氧化防御和细胞周期调控三个方向,为理解该类配合物在胶质瘤细胞中的生物学效应提供 qRT-PCR 层面的表达证据。
【数据内容】
数据集包含定量实时 PCR 获得的 raw Ct 值,以及经过处理的相对表达数据。目标基因包括 DNA 损伤应答相关的 ATM 和 ATR,抗氧化防御相关的 CAT、SOD2 和 GPX1,以及细胞周期调控相关的 CDKN1A。参考基因选用 RNA18SN5 和 ACTB。相对基因表达通过 ΔΔCt 方法计算,并以 RQ = 2^−ΔΔCt 的形式表达。 deposited 文件包括 raw Ct 数据、归一化表达值、实验分组键,以及一个包含详细方法学信息和变量说明的 README 文件。
【采集与来源】
数据来自 LN229 人胶质瘤细胞的 qRT-PCR 实验,细胞经 C1 和 C2 两种铜-苯并咪唑配合物处理 48 小时,浓度分别为 8.23 µM 和 5.93 µM,对应各自的 IC50 值。数据来源站为 doi.org,作者为 Korga-Plewko, Agnieszka,机构为 RepOD,发布时间为 2026 年。源站未提供样本量、生物学重复次数、具体实验批次及仪器型号等更细的采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于胶质瘤细胞在铜-苯并咪唑配合物暴露下基因表达变化的研究,可用于考察 DNA 损伤应答、抗氧化防御与细胞周期调控相关基因的转录响应,也可作为 qRT-PCR 相对表达计算与结果复核的参考数据。其 raw Ct 与归一化表达值可用于方法学比较、表达趋势观察以及与其他脑肿瘤相关表达数据的对照分析。
【使用方法】
使用时可结合 raw Ct 数据、归一化表达值和实验分组键进行分组对应,并参照 README 文件中的方法学信息与变量说明理解数据结构。相对表达以 ΔΔCt 法计算,RQ = 2^−ΔΔCt,参考基因为 RNA18SN5 和 ACTB。分析时应先明确分组键与样本的对应关系,再依据归一化表达值开展组间比较。源站未提供具体的软件操作步骤或代码示例。
【质量与限制】
源站未提供关于重复次数、批次效应、质控指标及数据完整性验证的详细信息。该数据集仅覆盖 ATM、ATR、CAT、SOD2、GPX1 和 CDKN1A 等有限基因,参考基因为 RNA18SN5 和 ACTB,实验条件限定为 LN229 细胞、48 小时处理及 C1 与 C2 的 IC50 浓度,结论外推需考虑这些限定条件。源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
作者为 Korga-Plewko, Agnieszka,机构为 RepOD,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。源站未提供具体的许可条款与引用格式信息。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.18150/righip
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含定量实时PCR(qRT-PCR)基因表达数据,这些数据来自LN229人胶质瘤细胞,该细胞用两种铜-苯并咪唑配合物C1和C2处理48小时,浓度分别对应其IC50值(分别为8.23 µM和5.93 µM)。数据集包括参与DNA损伤应答(ATM、ATR)、抗氧化防御(CAT、SOD2、GPX1)和细胞周期调控(CDKN1A)的基因的原始Ct值和处理后相对表达数据。RNA18SN5和ACTB被用作参考基因。相对基因表达使用ΔΔCt方法计算,并以RQ = 2^−ΔΔCt表示。存放的文件包括原始Ct数据、归一化表达值、实验组键以及包含详细方法学信息和变量描述的README文件。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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