配对原发与复发胶质母细胞瘤DNA修复与增殖转录共变可复现性档案

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22901434

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 361.4 MB。

数据说明

本数据集包含“配对原发与复发胶质母细胞瘤中DNA修复与增殖转录的共变”的计算可重复性材料。它支持对公开数据的二次分析：GSE62153（15对原发–复发 bulk 配对）、GSE174554（22对恶性细胞 pseudobulk 配对），以及 CARE/GSE274546 扩展集（37对合格配对，排除可能与 bulk 队列共享的机构）。这些计数并不被断言为跨研究经核实的74名唯一个体。该存档包括作者生成的分析代码、保存的聚合与标准化输入、配对与合格性记录、固定的 MSigDB 2024.1.Hs 基因集定义、统计表、保存的患者 bootstrap 对象、图表，以及来源/校验和记录。在原始发现已知后计划开展的额外分析，包括每个队列2，000个表达匹配的基因集参考，以及在三个主要队列和符合30核与50核规则的合格 CARE 状态中进行的患者影响诊断。主要平均变化/截距终点和原始多重性家族均予保留。发布准备期间未添加新的生物学分析。

这些是用于公共数据再分析的可重复性材料，并非新的实验数据、临床验证或手稿的预印本。未声称获得期刊接收。大型原始细胞级矩阵仍保留在GEO。在再分发权利不够明确的情况下，部分第三方源代码、论文补充材料、全文文章和注释资源被省略；原始来源、版本、哈希值和恢复说明均予以保留。所包含的对象支持核心的已保存输入重放。在将材料提取到同一台Windows计算机上的另一目录后，进行了最低限度的基线检查；这并非新系统验证。关于确切范围和组件特定权利，请参见README_ZENODO.md和LICENSES_AND_SOURCES.md。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。