新诊断胶质母细胞瘤前瞻性队列：MMP2与MMP9表达分析及与神经影像特征的相关性

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03526822

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数据说明

条件：脑肿瘤。胶质母细胞瘤是成人中最常见且最具侵袭性的原发性脑肿瘤。一个研究团队最近表明，基质金属蛋白酶-2（MMP2）和基质金属蛋白酶-9（MMP9）的基线血浆水平与复发性胶质母细胞瘤患者的贝伐珠单抗活性相关。迄今为止，该结果的生物学原理仍不清楚，但MMP2可能参与经典血管生成，而MMP9可能促进血管发生。研究目标是将MMP2和MMP9的血浆水平与其核糖核酸（RNA）和组织蛋白表达、活性以及患者神经影像学特征进行关联分析。分析围手术期及放化疗后MMP2和MMP9血浆水平的变化。方法：在新诊断的胶质母细胞瘤患者中，将于术前、术后、放疗前、辅助替莫唑胺治疗前及复发时，通过酶联免疫吸附测定（ELISA）分析MMP2、MMP9、血管内皮生长因子-A（VEGFA）、血管内皮生长因子受体-2（VEGFR2）、基质细胞衍生因子1（SDF1）和趋化因子受体-4（CXCR4）的血浆水平。

这些因子的RNA表达将通过逆转录聚合酶链反应（RT-qPCR）在冷冻肿瘤样本上进行分析，而蛋白表达则通过ELISA和免疫组织化学进行分析。MMP2和MMP9的酶活性将通过酶谱法进行分析。肿瘤体积、浸润和灌注程度将在手术前后以及辅助替莫唑胺治疗前进行的磁共振成像（MRI）上进行分析。神经影像学特征将与这些因子的血浆和组织表达进行相关性分析。预期结果是更好地界定MMP2、MMP9的表达谱及其治疗期间血浆水平的变化，这是其临床应用的先决条件。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。